Protein–RNA interactions for Protein: O15034

RIMBP2, RIMS-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMBP2O15034 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RIMBP2O15034 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RIMBP2O15034 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RIMBP2O15034 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RIMBP2O15034 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RIMBP2O15034 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RIMBP2O15034 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RIMBP2O15034 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RIMBP2O15034 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RIMBP2O15034 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RIMBP2O15034 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RIMBP2O15034 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RIMBP2O15034 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RIMBP2O15034 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RIMBP2O15034 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RIMBP2O15034 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RIMBP2O15034 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RIMBP2O15034 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RIMBP2O15034 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RIMBP2O15034 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RIMBP2O15034 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RIMBP2O15034 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RIMBP2O15034 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RIMBP2O15034 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RIMBP2O15034 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RIMBP2O15034 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RIMBP2O15034 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RIMBP2O15034 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RIMBP2O15034 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RIMBP2O15034 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RIMBP2O15034 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RIMBP2O15034 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RIMBP2O15034 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RIMBP2O15034 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RIMBP2O15034 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RIMBP2O15034 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RIMBP2O15034 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RIMBP2O15034 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RIMBP2O15034 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RIMBP2O15034 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RIMBP2O15034 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RIMBP2O15034 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RIMBP2O15034 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RIMBP2O15034 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RIMBP2O15034 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RIMBP2O15034 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RIMBP2O15034 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RIMBP2O15034 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RIMBP2O15034 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RIMBP2O15034 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RIMBP2O15034 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RIMBP2O15034 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RIMBP2O15034 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RIMBP2O15034 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RIMBP2O15034 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RIMBP2O15034 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RIMBP2O15034 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RIMBP2O15034 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RIMBP2O15034 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RIMBP2O15034 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RIMBP2O15034 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RIMBP2O15034 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RIMBP2O15034 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RIMBP2O15034 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RIMBP2O15034 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RIMBP2O15034 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RIMBP2O15034 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RIMBP2O15034 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RIMBP2O15034 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RIMBP2O15034 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RIMBP2O15034 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RIMBP2O15034 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RIMBP2O15034 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RIMBP2O15034 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RIMBP2O15034 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RIMBP2O15034 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RIMBP2O15034 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RIMBP2O15034 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RIMBP2O15034 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RIMBP2O15034 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RIMBP2O15034 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RIMBP2O15034 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RIMBP2O15034 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RIMBP2O15034 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RIMBP2O15034 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RIMBP2O15034 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RIMBP2O15034 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RIMBP2O15034 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RIMBP2O15034 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RIMBP2O15034 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RIMBP2O15034 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RIMBP2O15034 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RIMBP2O15034 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RIMBP2O15034 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RIMBP2O15034 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RIMBP2O15034 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RIMBP2O15034 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RIMBP2O15034 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RIMBP2O15034 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RIMBP2O15034 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms