Protein–RNA interactions for Protein: O14920

IKBKB, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBKBO14920 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IKBKBO14920 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IKBKBO14920 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IKBKBO14920 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IKBKBO14920 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IKBKBO14920 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IKBKBO14920 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IKBKBO14920 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IKBKBO14920 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IKBKBO14920 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IKBKBO14920 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
IKBKBO14920 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IKBKBO14920 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
IKBKBO14920 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
IKBKBO14920 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IKBKBO14920 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IKBKBO14920 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
IKBKBO14920 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
IKBKBO14920 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IKBKBO14920 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
IKBKBO14920 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23■■□□□ 1.27
IKBKBO14920 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
IKBKBO14920 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
IKBKBO14920 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IKBKBO14920 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
IKBKBO14920 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23■■□□□ 1.27
IKBKBO14920 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23■■□□□ 1.27
IKBKBO14920 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23■■□□□ 1.27
IKBKBO14920 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IKBKBO14920 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IKBKBO14920 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23■■□□□ 1.27
IKBKBO14920 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IKBKBO14920 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IKBKBO14920 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IKBKBO14920 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IKBKBO14920 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IKBKBO14920 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IKBKBO14920 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IKBKBO14920 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IKBKBO14920 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IKBKBO14920 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IKBKBO14920 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IKBKBO14920 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IKBKBO14920 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IKBKBO14920 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IKBKBO14920 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IKBKBO14920 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IKBKBO14920 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IKBKBO14920 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IKBKBO14920 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IKBKBO14920 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IKBKBO14920 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IKBKBO14920 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IKBKBO14920 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IKBKBO14920 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IKBKBO14920 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IKBKBO14920 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IKBKBO14920 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IKBKBO14920 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IKBKBO14920 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IKBKBO14920 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IKBKBO14920 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IKBKBO14920 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IKBKBO14920 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IKBKBO14920 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IKBKBO14920 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IKBKBO14920 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IKBKBO14920 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IKBKBO14920 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IKBKBO14920 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IKBKBO14920 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IKBKBO14920 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IKBKBO14920 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IKBKBO14920 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IKBKBO14920 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IKBKBO14920 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IKBKBO14920 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IKBKBO14920 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IKBKBO14920 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IKBKBO14920 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IKBKBO14920 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IKBKBO14920 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IKBKBO14920 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IKBKBO14920 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
IKBKBO14920 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IKBKBO14920 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IKBKBO14920 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IKBKBO14920 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IKBKBO14920 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
IKBKBO14920 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IKBKBO14920 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
IKBKBO14920 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IKBKBO14920 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IKBKBO14920 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IKBKBO14920 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IKBKBO14920 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IKBKBO14920 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IKBKBO14920 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IKBKBO14920 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IKBKBO14920 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms