Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms