Protein–RNA interactions for Protein: O00570

SOX1, Transcription factor SOX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX1O00570 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOX1O00570 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOX1O00570 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOX1O00570 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX1O00570 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX1O00570 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX1O00570 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX1O00570 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX1O00570 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX1O00570 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX1O00570 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX1O00570 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX1O00570 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX1O00570 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX1O00570 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX1O00570 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOX1O00570 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOX1O00570 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOX1O00570 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOX1O00570 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOX1O00570 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOX1O00570 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOX1O00570 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOX1O00570 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOX1O00570 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOX1O00570 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOX1O00570 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SOX1O00570 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SOX1O00570 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SOX1O00570 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOX1O00570 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOX1O00570 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOX1O00570 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOX1O00570 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOX1O00570 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOX1O00570 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOX1O00570 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOX1O00570 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOX1O00570 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOX1O00570 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOX1O00570 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOX1O00570 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOX1O00570 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SOX1O00570 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SOX1O00570 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SOX1O00570 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SOX1O00570 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SOX1O00570 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SOX1O00570 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SOX1O00570 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOX1O00570 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOX1O00570 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOX1O00570 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOX1O00570 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOX1O00570 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOX1O00570 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOX1O00570 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOX1O00570 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOX1O00570 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOX1O00570 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOX1O00570 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SOX1O00570 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOX1O00570 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOX1O00570 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SOX1O00570 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOX1O00570 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOX1O00570 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOX1O00570 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOX1O00570 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOX1O00570 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOX1O00570 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOX1O00570 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SOX1O00570 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOX1O00570 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOX1O00570 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOX1O00570 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SOX1O00570 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOX1O00570 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOX1O00570 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOX1O00570 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOX1O00570 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SOX1O00570 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOX1O00570 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOX1O00570 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOX1O00570 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOX1O00570 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOX1O00570 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOX1O00570 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOX1O00570 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SOX1O00570 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOX1O00570 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOX1O00570 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOX1O00570 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SOX1O00570 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOX1O00570 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOX1O00570 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOX1O00570 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOX1O00570 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOX1O00570 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOX1O00570 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms