Protein–RNA interactions for Protein: O00411

POLRMT, DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLRMTO00411 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLRMTO00411 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLRMTO00411 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLRMTO00411 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLRMTO00411 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLRMTO00411 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLRMTO00411 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLRMTO00411 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLRMTO00411 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
POLRMTO00411 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLRMTO00411 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLRMTO00411 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLRMTO00411 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLRMTO00411 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLRMTO00411 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLRMTO00411 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
POLRMTO00411 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLRMTO00411 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLRMTO00411 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLRMTO00411 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLRMTO00411 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLRMTO00411 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLRMTO00411 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLRMTO00411 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
POLRMTO00411 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLRMTO00411 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLRMTO00411 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLRMTO00411 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLRMTO00411 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLRMTO00411 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLRMTO00411 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLRMTO00411 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLRMTO00411 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
POLRMTO00411 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLRMTO00411 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLRMTO00411 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLRMTO00411 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLRMTO00411 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLRMTO00411 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLRMTO00411 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLRMTO00411 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLRMTO00411 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLRMTO00411 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLRMTO00411 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLRMTO00411 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLRMTO00411 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
POLRMTO00411 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLRMTO00411 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLRMTO00411 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLRMTO00411 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
POLRMTO00411 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLRMTO00411 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLRMTO00411 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLRMTO00411 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLRMTO00411 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
POLRMTO00411 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLRMTO00411 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLRMTO00411 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLRMTO00411 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLRMTO00411 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLRMTO00411 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLRMTO00411 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLRMTO00411 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLRMTO00411 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLRMTO00411 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLRMTO00411 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLRMTO00411 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLRMTO00411 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLRMTO00411 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLRMTO00411 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLRMTO00411 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLRMTO00411 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLRMTO00411 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLRMTO00411 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLRMTO00411 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLRMTO00411 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLRMTO00411 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLRMTO00411 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLRMTO00411 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLRMTO00411 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLRMTO00411 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLRMTO00411 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLRMTO00411 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLRMTO00411 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLRMTO00411 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLRMTO00411 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLRMTO00411 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLRMTO00411 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLRMTO00411 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLRMTO00411 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLRMTO00411 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLRMTO00411 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLRMTO00411 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLRMTO00411 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLRMTO00411 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLRMTO00411 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLRMTO00411 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLRMTO00411 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLRMTO00411 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLRMTO00411 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms