Protein–RNA interactions for Protein: O00370

LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
O00370 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
O00370 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
O00370 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
O00370 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
O00370 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
O00370 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
O00370 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
O00370 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
O00370 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
O00370 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
O00370 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
O00370 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
O00370 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
O00370 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
O00370 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
O00370 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
O00370 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
O00370 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
O00370 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
O00370 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
O00370 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
O00370 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
O00370 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
O00370 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
O00370 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
O00370 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
O00370 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
O00370 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
O00370 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
O00370 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
O00370 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
O00370 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
O00370 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
O00370 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
O00370 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
O00370 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
O00370 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
O00370 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
O00370 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
O00370 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
O00370 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
O00370 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
O00370 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
O00370 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
O00370 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
O00370 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
O00370 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
O00370 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
O00370 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
O00370 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
O00370 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
O00370 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
O00370 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
O00370 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
O00370 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
O00370 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
O00370 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
O00370 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
O00370 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
O00370 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
O00370 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
O00370 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
O00370 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
O00370 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
O00370 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
O00370 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
O00370 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
O00370 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
O00370 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
O00370 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
O00370 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
O00370 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
O00370 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
O00370 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
O00370 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
O00370 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
O00370 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
O00370 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
O00370 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
O00370 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
O00370 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
O00370 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
O00370 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
O00370 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
O00370 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
O00370 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
O00370 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
O00370 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
O00370 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
O00370 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
O00370 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
O00370 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
O00370 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
O00370 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
O00370 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
O00370 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
O00370 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
O00370 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
O00370 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
O00370 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms