Protein–RNA interactions for Protein: O00268

TAF4, Transcription initiation factor TFIID subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4O00268 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TAF4O00268 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TAF4O00268 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TAF4O00268 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TAF4O00268 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TAF4O00268 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TAF4O00268 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF4O00268 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF4O00268 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF4O00268 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF4O00268 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF4O00268 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF4O00268 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF4O00268 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF4O00268 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF4O00268 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF4O00268 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF4O00268 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF4O00268 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF4O00268 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF4O00268 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF4O00268 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF4O00268 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF4O00268 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF4O00268 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF4O00268 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF4O00268 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF4O00268 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF4O00268 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF4O00268 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF4O00268 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF4O00268 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF4O00268 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF4O00268 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF4O00268 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF4O00268 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF4O00268 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF4O00268 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF4O00268 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF4O00268 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF4O00268 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF4O00268 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF4O00268 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF4O00268 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF4O00268 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF4O00268 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF4O00268 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF4O00268 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF4O00268 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF4O00268 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF4O00268 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF4O00268 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF4O00268 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF4O00268 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF4O00268 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF4O00268 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF4O00268 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF4O00268 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF4O00268 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF4O00268 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF4O00268 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF4O00268 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF4O00268 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF4O00268 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF4O00268 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF4O00268 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF4O00268 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF4O00268 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF4O00268 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF4O00268 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF4O00268 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF4O00268 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF4O00268 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF4O00268 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF4O00268 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF4O00268 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF4O00268 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF4O00268 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF4O00268 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF4O00268 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF4O00268 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF4O00268 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF4O00268 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF4O00268 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF4O00268 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF4O00268 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF4O00268 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF4O00268 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF4O00268 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF4O00268 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF4O00268 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF4O00268 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TAF4O00268 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TAF4O00268 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TAF4O00268 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TAF4O00268 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TAF4O00268 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TAF4O00268 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TAF4O00268 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TAF4O00268 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms