Protein–RNA interactions for Protein: O00192

ARVCF, Armadillo repeat protein deleted in velo-cardio-facial syndrome, humanhuman

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARVCFO00192 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARVCFO00192 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARVCFO00192 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARVCFO00192 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARVCFO00192 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ARVCFO00192 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARVCFO00192 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARVCFO00192 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARVCFO00192 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARVCFO00192 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARVCFO00192 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARVCFO00192 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARVCFO00192 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARVCFO00192 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARVCFO00192 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARVCFO00192 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARVCFO00192 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARVCFO00192 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARVCFO00192 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARVCFO00192 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARVCFO00192 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ARVCFO00192 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARVCFO00192 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARVCFO00192 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARVCFO00192 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARVCFO00192 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARVCFO00192 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARVCFO00192 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARVCFO00192 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARVCFO00192 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARVCFO00192 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARVCFO00192 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ARVCFO00192 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARVCFO00192 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARVCFO00192 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARVCFO00192 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARVCFO00192 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARVCFO00192 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARVCFO00192 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ARVCFO00192 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARVCFO00192 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARVCFO00192 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARVCFO00192 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARVCFO00192 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARVCFO00192 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARVCFO00192 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARVCFO00192 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARVCFO00192 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARVCFO00192 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ARVCFO00192 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARVCFO00192 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ARVCFO00192 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARVCFO00192 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARVCFO00192 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARVCFO00192 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARVCFO00192 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARVCFO00192 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARVCFO00192 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARVCFO00192 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARVCFO00192 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARVCFO00192 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARVCFO00192 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ARVCFO00192 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARVCFO00192 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARVCFO00192 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARVCFO00192 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARVCFO00192 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARVCFO00192 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARVCFO00192 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARVCFO00192 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARVCFO00192 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARVCFO00192 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARVCFO00192 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARVCFO00192 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARVCFO00192 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARVCFO00192 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARVCFO00192 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ARVCFO00192 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ARVCFO00192 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ARVCFO00192 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARVCFO00192 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARVCFO00192 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARVCFO00192 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARVCFO00192 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARVCFO00192 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARVCFO00192 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ARVCFO00192 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARVCFO00192 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARVCFO00192 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ARVCFO00192 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARVCFO00192 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARVCFO00192 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARVCFO00192 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARVCFO00192 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARVCFO00192 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ARVCFO00192 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARVCFO00192 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARVCFO00192 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARVCFO00192 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARVCFO00192 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms