Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNAP23O00161 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNAP23O00161 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNAP23O00161 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNAP23O00161 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNAP23O00161 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNAP23O00161 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNAP23O00161 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNAP23O00161 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SNAP23O00161 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SNAP23O00161 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNAP23O00161 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SNAP23O00161 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNAP23O00161 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNAP23O00161 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNAP23O00161 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNAP23O00161 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNAP23O00161 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNAP23O00161 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNAP23O00161 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNAP23O00161 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNAP23O00161 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNAP23O00161 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNAP23O00161 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNAP23O00161 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNAP23O00161 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNAP23O00161 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNAP23O00161 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNAP23O00161 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNAP23O00161 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNAP23O00161 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNAP23O00161 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SNAP23O00161 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNAP23O00161 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNAP23O00161 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNAP23O00161 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNAP23O00161 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNAP23O00161 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNAP23O00161 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SNAP23O00161 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNAP23O00161 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNAP23O00161 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SNAP23O00161 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNAP23O00161 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNAP23O00161 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNAP23O00161 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNAP23O00161 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNAP23O00161 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNAP23O00161 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNAP23O00161 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNAP23O00161 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNAP23O00161 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNAP23O00161 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNAP23O00161 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNAP23O00161 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNAP23O00161 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNAP23O00161 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SNAP23O00161 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNAP23O00161 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SNAP23O00161 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNAP23O00161 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNAP23O00161 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNAP23O00161 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNAP23O00161 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNAP23O00161 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNAP23O00161 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNAP23O00161 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNAP23O00161 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNAP23O00161 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNAP23O00161 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNAP23O00161 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNAP23O00161 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNAP23O00161 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNAP23O00161 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SNAP23O00161 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNAP23O00161 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNAP23O00161 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNAP23O00161 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNAP23O00161 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNAP23O00161 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SNAP23O00161 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNAP23O00161 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNAP23O00161 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNAP23O00161 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNAP23O00161 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNAP23O00161 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNAP23O00161 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNAP23O00161 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNAP23O00161 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNAP23O00161 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNAP23O00161 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNAP23O00161 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNAP23O00161 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNAP23O00161 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNAP23O00161 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNAP23O00161 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNAP23O00161 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNAP23O00161 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNAP23O00161 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNAP23O00161 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms