Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCER2I3L3R5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCER2I3L3R5 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCER2I3L3R5 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CCER2I3L3R5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CCER2I3L3R5 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCER2I3L3R5 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCER2I3L3R5 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCER2I3L3R5 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCER2I3L3R5 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCER2I3L3R5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCER2I3L3R5 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCER2I3L3R5 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCER2I3L3R5 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCER2I3L3R5 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCER2I3L3R5 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCER2I3L3R5 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCER2I3L3R5 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCER2I3L3R5 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCER2I3L3R5 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCER2I3L3R5 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCER2I3L3R5 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCER2I3L3R5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCER2I3L3R5 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCER2I3L3R5 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCER2I3L3R5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCER2I3L3R5 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CCER2I3L3R5 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCER2I3L3R5 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCER2I3L3R5 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCER2I3L3R5 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCER2I3L3R5 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCER2I3L3R5 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCER2I3L3R5 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCER2I3L3R5 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCER2I3L3R5 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCER2I3L3R5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCER2I3L3R5 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCER2I3L3R5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCER2I3L3R5 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCER2I3L3R5 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCER2I3L3R5 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCER2I3L3R5 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCER2I3L3R5 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCER2I3L3R5 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCER2I3L3R5 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCER2I3L3R5 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCER2I3L3R5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCER2I3L3R5 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCER2I3L3R5 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
CCER2I3L3R5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCER2I3L3R5 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCER2I3L3R5 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCER2I3L3R5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCER2I3L3R5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CCER2I3L3R5 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCER2I3L3R5 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCER2I3L3R5 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCER2I3L3R5 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCER2I3L3R5 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCER2I3L3R5 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCER2I3L3R5 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCER2I3L3R5 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCER2I3L3R5 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCER2I3L3R5 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCER2I3L3R5 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCER2I3L3R5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCER2I3L3R5 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CCER2I3L3R5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CCER2I3L3R5 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CCER2I3L3R5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCER2I3L3R5 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCER2I3L3R5 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CCER2I3L3R5 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCER2I3L3R5 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCER2I3L3R5 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCER2I3L3R5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCER2I3L3R5 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCER2I3L3R5 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCER2I3L3R5 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCER2I3L3R5 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCER2I3L3R5 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCER2I3L3R5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCER2I3L3R5 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCER2I3L3R5 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCER2I3L3R5 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCER2I3L3R5 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCER2I3L3R5 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCER2I3L3R5 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCER2I3L3R5 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCER2I3L3R5 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCER2I3L3R5 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CCER2I3L3R5 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCER2I3L3R5 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCER2I3L3R5 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCER2I3L3R5 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCER2I3L3R5 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCER2I3L3R5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCER2I3L3R5 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCER2I3L3R5 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.1 ms