Protein–RNA interactions for Protein: F2Z398

LMO7DN, LMO7 downstream neighbor protein, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO7DNF2Z398 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LMO7DNF2Z398 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LMO7DNF2Z398 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LMO7DNF2Z398 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LMO7DNF2Z398 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
LMO7DNF2Z398 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
LMO7DNF2Z398 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LMO7DNF2Z398 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMO7DNF2Z398 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMO7DNF2Z398 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMO7DNF2Z398 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMO7DNF2Z398 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMO7DNF2Z398 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMO7DNF2Z398 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMO7DNF2Z398 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMO7DNF2Z398 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMO7DNF2Z398 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMO7DNF2Z398 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMO7DNF2Z398 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMO7DNF2Z398 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
LMO7DNF2Z398 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMO7DNF2Z398 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMO7DNF2Z398 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMO7DNF2Z398 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMO7DNF2Z398 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMO7DNF2Z398 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMO7DNF2Z398 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMO7DNF2Z398 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMO7DNF2Z398 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LMO7DNF2Z398 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LMO7DNF2Z398 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LMO7DNF2Z398 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LMO7DNF2Z398 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LMO7DNF2Z398 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LMO7DNF2Z398 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LMO7DNF2Z398 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
LMO7DNF2Z398 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LMO7DNF2Z398 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LMO7DNF2Z398 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LMO7DNF2Z398 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMO7DNF2Z398 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMO7DNF2Z398 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMO7DNF2Z398 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMO7DNF2Z398 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMO7DNF2Z398 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMO7DNF2Z398 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMO7DNF2Z398 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMO7DNF2Z398 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMO7DNF2Z398 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMO7DNF2Z398 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMO7DNF2Z398 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMO7DNF2Z398 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMO7DNF2Z398 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMO7DNF2Z398 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMO7DNF2Z398 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMO7DNF2Z398 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LMO7DNF2Z398 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LMO7DNF2Z398 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LMO7DNF2Z398 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LMO7DNF2Z398 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LMO7DNF2Z398 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LMO7DNF2Z398 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LMO7DNF2Z398 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LMO7DNF2Z398 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
LMO7DNF2Z398 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LMO7DNF2Z398 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LMO7DNF2Z398 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
LMO7DNF2Z398 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LMO7DNF2Z398 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LMO7DNF2Z398 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LMO7DNF2Z398 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LMO7DNF2Z398 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LMO7DNF2Z398 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LMO7DNF2Z398 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LMO7DNF2Z398 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LMO7DNF2Z398 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LMO7DNF2Z398 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LMO7DNF2Z398 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LMO7DNF2Z398 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms