Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms