Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
E9PCH4 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
E9PCH4 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC30.14■■■□□ 2.41
E9PCH4 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
E9PCH4 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
E9PCH4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
E9PCH4 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
E9PCH4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
E9PCH4 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
E9PCH4 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
E9PCH4 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
E9PCH4 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
E9PCH4 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
E9PCH4 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
E9PCH4 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
E9PCH4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
E9PCH4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
E9PCH4 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
E9PCH4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
E9PCH4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
E9PCH4 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
E9PCH4 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
E9PCH4 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
E9PCH4 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
E9PCH4 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
E9PCH4 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
E9PCH4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
E9PCH4 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
E9PCH4 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
E9PCH4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
E9PCH4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
E9PCH4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
E9PCH4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
E9PCH4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
E9PCH4 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
E9PCH4 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
E9PCH4 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
E9PCH4 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
E9PCH4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
E9PCH4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
E9PCH4 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
E9PCH4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
E9PCH4 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
E9PCH4 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
E9PCH4 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
E9PCH4 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
E9PCH4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
E9PCH4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
E9PCH4 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
E9PCH4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
E9PCH4 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
E9PCH4 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
E9PCH4 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
E9PCH4 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
E9PCH4 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
E9PCH4 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
E9PCH4 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
E9PCH4 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
E9PCH4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
E9PCH4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
E9PCH4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
E9PCH4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
E9PCH4 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
E9PCH4 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC30.09■■■□□ 2.41
E9PCH4 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
E9PCH4 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
E9PCH4 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
E9PCH4 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
E9PCH4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
E9PCH4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
E9PCH4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
E9PCH4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
E9PCH4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
E9PCH4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
E9PCH4 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
E9PCH4 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
E9PCH4 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
E9PCH4 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
E9PCH4 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
E9PCH4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
E9PCH4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
E9PCH4 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
E9PCH4 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
E9PCH4 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
E9PCH4 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.41
E9PCH4 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.41
E9PCH4 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.41
E9PCH4 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.41
E9PCH4 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.41
E9PCH4 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.41
E9PCH4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
E9PCH4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
E9PCH4 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
E9PCH4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
E9PCH4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
E9PCH4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
E9PCH4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
E9PCH4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
E9PCH4 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
E9PCH4 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms