Protein–RNA interactions for Protein: D6RJB6

USP17L20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 20, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L20D6RJB6 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP17L20D6RJB6 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP17L20D6RJB6 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP17L20D6RJB6 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP17L20D6RJB6 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP17L20D6RJB6 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP17L20D6RJB6 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP17L20D6RJB6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP17L20D6RJB6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP17L20D6RJB6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP17L20D6RJB6 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP17L20D6RJB6 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP17L20D6RJB6 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP17L20D6RJB6 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
USP17L20D6RJB6 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
USP17L20D6RJB6 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP17L20D6RJB6 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP17L20D6RJB6 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP17L20D6RJB6 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP17L20D6RJB6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP17L20D6RJB6 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP17L20D6RJB6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP17L20D6RJB6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L20D6RJB6 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L20D6RJB6 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L20D6RJB6 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L20D6RJB6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L20D6RJB6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L20D6RJB6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L20D6RJB6 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L20D6RJB6 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L20D6RJB6 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24■■□□□ 1.43
USP17L20D6RJB6 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L20D6RJB6 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L20D6RJB6 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L20D6RJB6 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L20D6RJB6 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L20D6RJB6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L20D6RJB6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L20D6RJB6 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L20D6RJB6 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L20D6RJB6 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L20D6RJB6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L20D6RJB6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L20D6RJB6 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24■■□□□ 1.43
USP17L20D6RJB6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L20D6RJB6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP17L20D6RJB6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP17L20D6RJB6 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP17L20D6RJB6 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP17L20D6RJB6 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP17L20D6RJB6 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP17L20D6RJB6 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP17L20D6RJB6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP17L20D6RJB6 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP17L20D6RJB6 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP17L20D6RJB6 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP17L20D6RJB6 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP17L20D6RJB6 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
USP17L20D6RJB6 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP17L20D6RJB6 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP17L20D6RJB6 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP17L20D6RJB6 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP17L20D6RJB6 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP17L20D6RJB6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP17L20D6RJB6 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP17L20D6RJB6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP17L20D6RJB6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP17L20D6RJB6 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP17L20D6RJB6 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP17L20D6RJB6 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP17L20D6RJB6 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP17L20D6RJB6 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP17L20D6RJB6 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP17L20D6RJB6 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP17L20D6RJB6 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP17L20D6RJB6 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP17L20D6RJB6 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP17L20D6RJB6 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP17L20D6RJB6 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP17L20D6RJB6 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP17L20D6RJB6 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP17L20D6RJB6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP17L20D6RJB6 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP17L20D6RJB6 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP17L20D6RJB6 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP17L20D6RJB6 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP17L20D6RJB6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP17L20D6RJB6 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
USP17L20D6RJB6 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP17L20D6RJB6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP17L20D6RJB6 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP17L20D6RJB6 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
USP17L20D6RJB6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP17L20D6RJB6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP17L20D6RJB6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP17L20D6RJB6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP17L20D6RJB6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP17L20D6RJB6 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP17L20D6RJB6 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms