Protein–RNA interactions for Protein: C9JLJ4

USP17L13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L13C9JLJ4 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP17L13C9JLJ4 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP17L13C9JLJ4 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP17L13C9JLJ4 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP17L13C9JLJ4 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP17L13C9JLJ4 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP17L13C9JLJ4 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP17L13C9JLJ4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP17L13C9JLJ4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP17L13C9JLJ4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP17L13C9JLJ4 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP17L13C9JLJ4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP17L13C9JLJ4 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP17L13C9JLJ4 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
USP17L13C9JLJ4 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
USP17L13C9JLJ4 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP17L13C9JLJ4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP17L13C9JLJ4 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP17L13C9JLJ4 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP17L13C9JLJ4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP17L13C9JLJ4 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP17L13C9JLJ4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP17L13C9JLJ4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L13C9JLJ4 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L13C9JLJ4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L13C9JLJ4 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L13C9JLJ4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L13C9JLJ4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L13C9JLJ4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L13C9JLJ4 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L13C9JLJ4 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L13C9JLJ4 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24■■□□□ 1.43
USP17L13C9JLJ4 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L13C9JLJ4 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L13C9JLJ4 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L13C9JLJ4 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L13C9JLJ4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L13C9JLJ4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L13C9JLJ4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L13C9JLJ4 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L13C9JLJ4 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L13C9JLJ4 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L13C9JLJ4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L13C9JLJ4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L13C9JLJ4 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24■■□□□ 1.43
USP17L13C9JLJ4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L13C9JLJ4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP17L13C9JLJ4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP17L13C9JLJ4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP17L13C9JLJ4 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP17L13C9JLJ4 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP17L13C9JLJ4 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP17L13C9JLJ4 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP17L13C9JLJ4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP17L13C9JLJ4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP17L13C9JLJ4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP17L13C9JLJ4 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP17L13C9JLJ4 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP17L13C9JLJ4 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
USP17L13C9JLJ4 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP17L13C9JLJ4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP17L13C9JLJ4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP17L13C9JLJ4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP17L13C9JLJ4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP17L13C9JLJ4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP17L13C9JLJ4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP17L13C9JLJ4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP17L13C9JLJ4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP17L13C9JLJ4 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP17L13C9JLJ4 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP17L13C9JLJ4 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP17L13C9JLJ4 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP17L13C9JLJ4 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP17L13C9JLJ4 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP17L13C9JLJ4 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP17L13C9JLJ4 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP17L13C9JLJ4 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP17L13C9JLJ4 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP17L13C9JLJ4 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP17L13C9JLJ4 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP17L13C9JLJ4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP17L13C9JLJ4 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP17L13C9JLJ4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP17L13C9JLJ4 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP17L13C9JLJ4 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP17L13C9JLJ4 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP17L13C9JLJ4 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP17L13C9JLJ4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP17L13C9JLJ4 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
USP17L13C9JLJ4 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP17L13C9JLJ4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP17L13C9JLJ4 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP17L13C9JLJ4 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
USP17L13C9JLJ4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP17L13C9JLJ4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP17L13C9JLJ4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP17L13C9JLJ4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP17L13C9JLJ4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP17L13C9JLJ4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP17L13C9JLJ4 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms