Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PATL2C9JE40 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PATL2C9JE40 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PATL2C9JE40 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PATL2C9JE40 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PATL2C9JE40 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PATL2C9JE40 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PATL2C9JE40 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PATL2C9JE40 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PATL2C9JE40 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PATL2C9JE40 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PATL2C9JE40 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PATL2C9JE40 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PATL2C9JE40 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PATL2C9JE40 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PATL2C9JE40 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PATL2C9JE40 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PATL2C9JE40 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PATL2C9JE40 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PATL2C9JE40 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PATL2C9JE40 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PATL2C9JE40 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PATL2C9JE40 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PATL2C9JE40 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PATL2C9JE40 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PATL2C9JE40 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PATL2C9JE40 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PATL2C9JE40 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PATL2C9JE40 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PATL2C9JE40 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PATL2C9JE40 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PATL2C9JE40 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PATL2C9JE40 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PATL2C9JE40 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PATL2C9JE40 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PATL2C9JE40 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PATL2C9JE40 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PATL2C9JE40 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PATL2C9JE40 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PATL2C9JE40 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PATL2C9JE40 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PATL2C9JE40 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PATL2C9JE40 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PATL2C9JE40 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PATL2C9JE40 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PATL2C9JE40 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PATL2C9JE40 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PATL2C9JE40 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PATL2C9JE40 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PATL2C9JE40 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PATL2C9JE40 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PATL2C9JE40 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PATL2C9JE40 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PATL2C9JE40 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PATL2C9JE40 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PATL2C9JE40 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PATL2C9JE40 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PATL2C9JE40 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PATL2C9JE40 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PATL2C9JE40 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PATL2C9JE40 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PATL2C9JE40 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PATL2C9JE40 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PATL2C9JE40 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PATL2C9JE40 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PATL2C9JE40 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PATL2C9JE40 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PATL2C9JE40 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PATL2C9JE40 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PATL2C9JE40 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PATL2C9JE40 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PATL2C9JE40 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PATL2C9JE40 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PATL2C9JE40 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PATL2C9JE40 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PATL2C9JE40 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PATL2C9JE40 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PATL2C9JE40 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PATL2C9JE40 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PATL2C9JE40 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PATL2C9JE40 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PATL2C9JE40 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PATL2C9JE40 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PATL2C9JE40 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PATL2C9JE40 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PATL2C9JE40 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PATL2C9JE40 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PATL2C9JE40 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PATL2C9JE40 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PATL2C9JE40 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PATL2C9JE40 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PATL2C9JE40 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PATL2C9JE40 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PATL2C9JE40 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PATL2C9JE40 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PATL2C9JE40 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PATL2C9JE40 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PATL2C9JE40 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PATL2C9JE40 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PATL2C9JE40 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms