Protein–RNA interactions for Protein: A8K0S8

MEIS3P2, Putative homeobox protein Meis3-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3P2A8K0S8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MEIS3P2A8K0S8 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MEIS3P2A8K0S8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MEIS3P2A8K0S8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MEIS3P2A8K0S8 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MEIS3P2A8K0S8 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MEIS3P2A8K0S8 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MEIS3P2A8K0S8 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MEIS3P2A8K0S8 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MEIS3P2A8K0S8 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MEIS3P2A8K0S8 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MEIS3P2A8K0S8 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MEIS3P2A8K0S8 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MEIS3P2A8K0S8 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MEIS3P2A8K0S8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MEIS3P2A8K0S8 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MEIS3P2A8K0S8 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MEIS3P2A8K0S8 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MEIS3P2A8K0S8 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MEIS3P2A8K0S8 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MEIS3P2A8K0S8 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MEIS3P2A8K0S8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MEIS3P2A8K0S8 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MEIS3P2A8K0S8 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MEIS3P2A8K0S8 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MEIS3P2A8K0S8 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MEIS3P2A8K0S8 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MEIS3P2A8K0S8 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MEIS3P2A8K0S8 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MEIS3P2A8K0S8 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MEIS3P2A8K0S8 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MEIS3P2A8K0S8 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MEIS3P2A8K0S8 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MEIS3P2A8K0S8 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MEIS3P2A8K0S8 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MEIS3P2A8K0S8 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MEIS3P2A8K0S8 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MEIS3P2A8K0S8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MEIS3P2A8K0S8 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MEIS3P2A8K0S8 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MEIS3P2A8K0S8 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MEIS3P2A8K0S8 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MEIS3P2A8K0S8 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MEIS3P2A8K0S8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MEIS3P2A8K0S8 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MEIS3P2A8K0S8 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MEIS3P2A8K0S8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MEIS3P2A8K0S8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MEIS3P2A8K0S8 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MEIS3P2A8K0S8 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MEIS3P2A8K0S8 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MEIS3P2A8K0S8 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MEIS3P2A8K0S8 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MEIS3P2A8K0S8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MEIS3P2A8K0S8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MEIS3P2A8K0S8 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MEIS3P2A8K0S8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MEIS3P2A8K0S8 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MEIS3P2A8K0S8 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MEIS3P2A8K0S8 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MEIS3P2A8K0S8 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MEIS3P2A8K0S8 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MEIS3P2A8K0S8 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MEIS3P2A8K0S8 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MEIS3P2A8K0S8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MEIS3P2A8K0S8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MEIS3P2A8K0S8 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MEIS3P2A8K0S8 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MEIS3P2A8K0S8 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MEIS3P2A8K0S8 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MEIS3P2A8K0S8 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MEIS3P2A8K0S8 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MEIS3P2A8K0S8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MEIS3P2A8K0S8 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MEIS3P2A8K0S8 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MEIS3P2A8K0S8 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MEIS3P2A8K0S8 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MEIS3P2A8K0S8 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MEIS3P2A8K0S8 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MEIS3P2A8K0S8 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MEIS3P2A8K0S8 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MEIS3P2A8K0S8 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MEIS3P2A8K0S8 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MEIS3P2A8K0S8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MEIS3P2A8K0S8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MEIS3P2A8K0S8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MEIS3P2A8K0S8 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MEIS3P2A8K0S8 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MEIS3P2A8K0S8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MEIS3P2A8K0S8 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MEIS3P2A8K0S8 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MEIS3P2A8K0S8 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MEIS3P2A8K0S8 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MEIS3P2A8K0S8 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MEIS3P2A8K0S8 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MEIS3P2A8K0S8 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MEIS3P2A8K0S8 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MEIS3P2A8K0S8 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MEIS3P2A8K0S8 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MEIS3P2A8K0S8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms