Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SOBPA7XYQ1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOBPA7XYQ1 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOBPA7XYQ1 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOBPA7XYQ1 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOBPA7XYQ1 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOBPA7XYQ1 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOBPA7XYQ1 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOBPA7XYQ1 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SOBPA7XYQ1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOBPA7XYQ1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOBPA7XYQ1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOBPA7XYQ1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOBPA7XYQ1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOBPA7XYQ1 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOBPA7XYQ1 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOBPA7XYQ1 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOBPA7XYQ1 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOBPA7XYQ1 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOBPA7XYQ1 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOBPA7XYQ1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOBPA7XYQ1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOBPA7XYQ1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOBPA7XYQ1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOBPA7XYQ1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOBPA7XYQ1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SOBPA7XYQ1 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SOBPA7XYQ1 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SOBPA7XYQ1 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SOBPA7XYQ1 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SOBPA7XYQ1 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SOBPA7XYQ1 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SOBPA7XYQ1 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SOBPA7XYQ1 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SOBPA7XYQ1 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SOBPA7XYQ1 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SOBPA7XYQ1 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SOBPA7XYQ1 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SOBPA7XYQ1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SOBPA7XYQ1 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SOBPA7XYQ1 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SOBPA7XYQ1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SOBPA7XYQ1 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SOBPA7XYQ1 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SOBPA7XYQ1 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SOBPA7XYQ1 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SOBPA7XYQ1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SOBPA7XYQ1 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SOBPA7XYQ1 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SOBPA7XYQ1 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SOBPA7XYQ1 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SOBPA7XYQ1 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SOBPA7XYQ1 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SOBPA7XYQ1 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SOBPA7XYQ1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SOBPA7XYQ1 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SOBPA7XYQ1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SOBPA7XYQ1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SOBPA7XYQ1 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SOBPA7XYQ1 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SOBPA7XYQ1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SOBPA7XYQ1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SOBPA7XYQ1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SOBPA7XYQ1 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SOBPA7XYQ1 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SOBPA7XYQ1 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SOBPA7XYQ1 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SOBPA7XYQ1 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SOBPA7XYQ1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SOBPA7XYQ1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SOBPA7XYQ1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SOBPA7XYQ1 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SOBPA7XYQ1 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SOBPA7XYQ1 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SOBPA7XYQ1 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SOBPA7XYQ1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SOBPA7XYQ1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SOBPA7XYQ1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SOBPA7XYQ1 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SOBPA7XYQ1 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SOBPA7XYQ1 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SOBPA7XYQ1 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SOBPA7XYQ1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SOBPA7XYQ1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SOBPA7XYQ1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SOBPA7XYQ1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SOBPA7XYQ1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SOBPA7XYQ1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOBPA7XYQ1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOBPA7XYQ1 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SOBPA7XYQ1 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOBPA7XYQ1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOBPA7XYQ1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOBPA7XYQ1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOBPA7XYQ1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SOBPA7XYQ1 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOBPA7XYQ1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOBPA7XYQ1 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOBPA7XYQ1 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOBPA7XYQ1 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms