Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM8

TTLL13P, Tubulin polyglutamylase TTLL13P, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL13PA6NNM8 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTLL13PA6NNM8 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTLL13PA6NNM8 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTLL13PA6NNM8 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTLL13PA6NNM8 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTLL13PA6NNM8 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTLL13PA6NNM8 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTLL13PA6NNM8 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTLL13PA6NNM8 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTLL13PA6NNM8 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTLL13PA6NNM8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTLL13PA6NNM8 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTLL13PA6NNM8 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTLL13PA6NNM8 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTLL13PA6NNM8 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TTLL13PA6NNM8 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TTLL13PA6NNM8 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTLL13PA6NNM8 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TTLL13PA6NNM8 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTLL13PA6NNM8 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTLL13PA6NNM8 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTLL13PA6NNM8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTLL13PA6NNM8 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTLL13PA6NNM8 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TTLL13PA6NNM8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTLL13PA6NNM8 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTLL13PA6NNM8 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTLL13PA6NNM8 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTLL13PA6NNM8 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTLL13PA6NNM8 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTLL13PA6NNM8 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTLL13PA6NNM8 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTLL13PA6NNM8 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TTLL13PA6NNM8 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTLL13PA6NNM8 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TTLL13PA6NNM8 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTLL13PA6NNM8 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTLL13PA6NNM8 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TTLL13PA6NNM8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTLL13PA6NNM8 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTLL13PA6NNM8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTLL13PA6NNM8 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTLL13PA6NNM8 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTLL13PA6NNM8 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTLL13PA6NNM8 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTLL13PA6NNM8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTLL13PA6NNM8 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTLL13PA6NNM8 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTLL13PA6NNM8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTLL13PA6NNM8 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTLL13PA6NNM8 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTLL13PA6NNM8 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTLL13PA6NNM8 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTLL13PA6NNM8 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTLL13PA6NNM8 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTLL13PA6NNM8 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTLL13PA6NNM8 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TTLL13PA6NNM8 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTLL13PA6NNM8 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTLL13PA6NNM8 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTLL13PA6NNM8 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTLL13PA6NNM8 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTLL13PA6NNM8 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTLL13PA6NNM8 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TTLL13PA6NNM8 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TTLL13PA6NNM8 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTLL13PA6NNM8 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTLL13PA6NNM8 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTLL13PA6NNM8 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTLL13PA6NNM8 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTLL13PA6NNM8 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTLL13PA6NNM8 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTLL13PA6NNM8 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTLL13PA6NNM8 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTLL13PA6NNM8 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTLL13PA6NNM8 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTLL13PA6NNM8 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TTLL13PA6NNM8 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTLL13PA6NNM8 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTLL13PA6NNM8 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TTLL13PA6NNM8 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTLL13PA6NNM8 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTLL13PA6NNM8 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTLL13PA6NNM8 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTLL13PA6NNM8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTLL13PA6NNM8 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTLL13PA6NNM8 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTLL13PA6NNM8 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTLL13PA6NNM8 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTLL13PA6NNM8 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTLL13PA6NNM8 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTLL13PA6NNM8 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TTLL13PA6NNM8 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTLL13PA6NNM8 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTLL13PA6NNM8 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTLL13PA6NNM8 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTLL13PA6NNM8 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTLL13PA6NNM8 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTLL13PA6NNM8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTLL13PA6NNM8 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms