Protein–RNA interactions for Protein: A6NL46

Putative UPF0607 protein ENSP00000332738, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NL46 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
A6NL46 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
A6NL46 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
A6NL46 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
A6NL46 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
A6NL46 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
A6NL46 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
A6NL46 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
A6NL46 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
A6NL46 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
A6NL46 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
A6NL46 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
A6NL46 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
A6NL46 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
A6NL46 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
A6NL46 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
A6NL46 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
A6NL46 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
A6NL46 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
A6NL46 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
A6NL46 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
A6NL46 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
A6NL46 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
A6NL46 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
A6NL46 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
A6NL46 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
A6NL46 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
A6NL46 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
A6NL46 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
A6NL46 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
A6NL46 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
A6NL46 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
A6NL46 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
A6NL46 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
A6NL46 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
A6NL46 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
A6NL46 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
A6NL46 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
A6NL46 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
A6NL46 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
A6NL46 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
A6NL46 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
A6NL46 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
A6NL46 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
A6NL46 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
A6NL46 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
A6NL46 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
A6NL46 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
A6NL46 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
A6NL46 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
A6NL46 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
A6NL46 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
A6NL46 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
A6NL46 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
A6NL46 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
A6NL46 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
A6NL46 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
A6NL46 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
A6NL46 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
A6NL46 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
A6NL46 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
A6NL46 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
A6NL46 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
A6NL46 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
A6NL46 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
A6NL46 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
A6NL46 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
A6NL46 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
A6NL46 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
A6NL46 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
A6NL46 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
A6NL46 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
A6NL46 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
A6NL46 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
A6NL46 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
A6NL46 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
A6NL46 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
A6NL46 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
A6NL46 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
A6NL46 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
A6NL46 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
A6NL46 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
A6NL46 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
A6NL46 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
A6NL46 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
A6NL46 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
A6NL46 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
A6NL46 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
A6NL46 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
A6NL46 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
A6NL46 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
A6NL46 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
A6NL46 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
A6NL46 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
A6NL46 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
A6NL46 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
A6NL46 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
A6NL46 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
A6NL46 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
A6NL46 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms