Protein–RNA interactions for Protein: A6NKD9

CCDC85C, Coiled-coil domain-containing protein 85C, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85CA6NKD9 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC85CA6NKD9 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC85CA6NKD9 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC85CA6NKD9 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC85CA6NKD9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC85CA6NKD9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC85CA6NKD9 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC85CA6NKD9 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC85CA6NKD9 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC85CA6NKD9 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC85CA6NKD9 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC85CA6NKD9 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC85CA6NKD9 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC85CA6NKD9 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC85CA6NKD9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC85CA6NKD9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC85CA6NKD9 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC85CA6NKD9 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC85CA6NKD9 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC85CA6NKD9 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC85CA6NKD9 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC85CA6NKD9 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC85CA6NKD9 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC85CA6NKD9 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC85CA6NKD9 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC85CA6NKD9 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC85CA6NKD9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC85CA6NKD9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC85CA6NKD9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC85CA6NKD9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC85CA6NKD9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC85CA6NKD9 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC85CA6NKD9 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC85CA6NKD9 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC85CA6NKD9 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC85CA6NKD9 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC85CA6NKD9 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC85CA6NKD9 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC85CA6NKD9 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC85CA6NKD9 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC85CA6NKD9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC85CA6NKD9 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC85CA6NKD9 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC85CA6NKD9 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC85CA6NKD9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC85CA6NKD9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC85CA6NKD9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC85CA6NKD9 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC85CA6NKD9 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC85CA6NKD9 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC85CA6NKD9 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC85CA6NKD9 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC85CA6NKD9 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC85CA6NKD9 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC85CA6NKD9 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC85CA6NKD9 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC85CA6NKD9 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC85CA6NKD9 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC85CA6NKD9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC85CA6NKD9 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC85CA6NKD9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC85CA6NKD9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC85CA6NKD9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC85CA6NKD9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC85CA6NKD9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC85CA6NKD9 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC85CA6NKD9 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC85CA6NKD9 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC85CA6NKD9 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC85CA6NKD9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC85CA6NKD9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC85CA6NKD9 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC85CA6NKD9 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC85CA6NKD9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC85CA6NKD9 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC85CA6NKD9 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC85CA6NKD9 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC85CA6NKD9 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC85CA6NKD9 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC85CA6NKD9 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC85CA6NKD9 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC85CA6NKD9 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC85CA6NKD9 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC85CA6NKD9 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC85CA6NKD9 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC85CA6NKD9 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC85CA6NKD9 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC85CA6NKD9 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC85CA6NKD9 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC85CA6NKD9 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC85CA6NKD9 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC85CA6NKD9 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC85CA6NKD9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC85CA6NKD9 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC85CA6NKD9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC85CA6NKD9 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC85CA6NKD9 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC85CA6NKD9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC85CA6NKD9 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC85CA6NKD9 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms