Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
ZNF316A6NFI3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ZNF316A6NFI3 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ZNF316A6NFI3 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ZNF316A6NFI3 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ZNF316A6NFI3 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ZNF316A6NFI3 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ZNF316A6NFI3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ZNF316A6NFI3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ZNF316A6NFI3 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ZNF316A6NFI3 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ZNF316A6NFI3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ZNF316A6NFI3 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ZNF316A6NFI3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
ZNF316A6NFI3 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ZNF316A6NFI3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ZNF316A6NFI3 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ZNF316A6NFI3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ZNF316A6NFI3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ZNF316A6NFI3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ZNF316A6NFI3 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ZNF316A6NFI3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ZNF316A6NFI3 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ZNF316A6NFI3 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ZNF316A6NFI3 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ZNF316A6NFI3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ZNF316A6NFI3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ZNF316A6NFI3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZNF316A6NFI3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZNF316A6NFI3 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZNF316A6NFI3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZNF316A6NFI3 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
ZNF316A6NFI3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZNF316A6NFI3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZNF316A6NFI3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZNF316A6NFI3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZNF316A6NFI3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZNF316A6NFI3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZNF316A6NFI3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZNF316A6NFI3 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZNF316A6NFI3 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZNF316A6NFI3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZNF316A6NFI3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZNF316A6NFI3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZNF316A6NFI3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZNF316A6NFI3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZNF316A6NFI3 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZNF316A6NFI3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZNF316A6NFI3 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZNF316A6NFI3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZNF316A6NFI3 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZNF316A6NFI3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
ZNF316A6NFI3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZNF316A6NFI3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZNF316A6NFI3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZNF316A6NFI3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
ZNF316A6NFI3 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZNF316A6NFI3 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZNF316A6NFI3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZNF316A6NFI3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZNF316A6NFI3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZNF316A6NFI3 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
ZNF316A6NFI3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
ZNF316A6NFI3 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZNF316A6NFI3 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZNF316A6NFI3 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZNF316A6NFI3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZNF316A6NFI3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZNF316A6NFI3 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZNF316A6NFI3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZNF316A6NFI3 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ZNF316A6NFI3 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ZNF316A6NFI3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ZNF316A6NFI3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ZNF316A6NFI3 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ZNF316A6NFI3 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ZNF316A6NFI3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ZNF316A6NFI3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ZNF316A6NFI3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ZNF316A6NFI3 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ZNF316A6NFI3 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
ZNF316A6NFI3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ZNF316A6NFI3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ZNF316A6NFI3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ZNF316A6NFI3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ZNF316A6NFI3 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ZNF316A6NFI3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ZNF316A6NFI3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ZNF316A6NFI3 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ZNF316A6NFI3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ZNF316A6NFI3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ZNF316A6NFI3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ZNF316A6NFI3 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ZNF316A6NFI3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ZNF316A6NFI3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ZNF316A6NFI3 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ZNF316A6NFI3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ZNF316A6NFI3 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ZNF316A6NFI3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZNF316A6NFI3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms