Protein–RNA interactions for Protein: A6NFD8

HELT, Hairy and enhancer of split-related protein HELT, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELTA6NFD8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms