Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PALM3A6NDB9 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PALM3A6NDB9 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PALM3A6NDB9 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PALM3A6NDB9 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PALM3A6NDB9 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PALM3A6NDB9 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PALM3A6NDB9 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PALM3A6NDB9 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PALM3A6NDB9 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PALM3A6NDB9 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PALM3A6NDB9 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PALM3A6NDB9 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PALM3A6NDB9 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PALM3A6NDB9 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PALM3A6NDB9 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PALM3A6NDB9 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PALM3A6NDB9 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PALM3A6NDB9 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PALM3A6NDB9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PALM3A6NDB9 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PALM3A6NDB9 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PALM3A6NDB9 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PALM3A6NDB9 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PALM3A6NDB9 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PALM3A6NDB9 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PALM3A6NDB9 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PALM3A6NDB9 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PALM3A6NDB9 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PALM3A6NDB9 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PALM3A6NDB9 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PALM3A6NDB9 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PALM3A6NDB9 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PALM3A6NDB9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PALM3A6NDB9 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PALM3A6NDB9 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PALM3A6NDB9 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PALM3A6NDB9 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PALM3A6NDB9 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PALM3A6NDB9 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PALM3A6NDB9 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PALM3A6NDB9 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PALM3A6NDB9 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PALM3A6NDB9 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PALM3A6NDB9 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PALM3A6NDB9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PALM3A6NDB9 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PALM3A6NDB9 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PALM3A6NDB9 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PALM3A6NDB9 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PALM3A6NDB9 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PALM3A6NDB9 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PALM3A6NDB9 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PALM3A6NDB9 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PALM3A6NDB9 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PALM3A6NDB9 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PALM3A6NDB9 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PALM3A6NDB9 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PALM3A6NDB9 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PALM3A6NDB9 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PALM3A6NDB9 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PALM3A6NDB9 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PALM3A6NDB9 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PALM3A6NDB9 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PALM3A6NDB9 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PALM3A6NDB9 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PALM3A6NDB9 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PALM3A6NDB9 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PALM3A6NDB9 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PALM3A6NDB9 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PALM3A6NDB9 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PALM3A6NDB9 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PALM3A6NDB9 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PALM3A6NDB9 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PALM3A6NDB9 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PALM3A6NDB9 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PALM3A6NDB9 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PALM3A6NDB9 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PALM3A6NDB9 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PALM3A6NDB9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PALM3A6NDB9 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PALM3A6NDB9 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PALM3A6NDB9 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PALM3A6NDB9 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PALM3A6NDB9 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PALM3A6NDB9 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PALM3A6NDB9 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PALM3A6NDB9 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PALM3A6NDB9 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PALM3A6NDB9 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PALM3A6NDB9 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PALM3A6NDB9 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PALM3A6NDB9 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PALM3A6NDB9 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PALM3A6NDB9 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PALM3A6NDB9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PALM3A6NDB9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PALM3A6NDB9 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PALM3A6NDB9 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PALM3A6NDB9 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms