Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI5

LINC00862, Putative transmembrane protein encoded by LINC00862, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00862A6NCI5 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00862A6NCI5 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00862A6NCI5 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00862A6NCI5 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00862A6NCI5 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00862A6NCI5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00862A6NCI5 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00862A6NCI5 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00862A6NCI5 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00862A6NCI5 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00862A6NCI5 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00862A6NCI5 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00862A6NCI5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00862A6NCI5 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00862A6NCI5 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00862A6NCI5 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00862A6NCI5 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00862A6NCI5 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00862A6NCI5 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00862A6NCI5 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00862A6NCI5 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00862A6NCI5 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00862A6NCI5 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00862A6NCI5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00862A6NCI5 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00862A6NCI5 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00862A6NCI5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00862A6NCI5 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00862A6NCI5 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00862A6NCI5 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00862A6NCI5 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00862A6NCI5 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00862A6NCI5 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00862A6NCI5 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00862A6NCI5 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00862A6NCI5 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00862A6NCI5 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00862A6NCI5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00862A6NCI5 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00862A6NCI5 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00862A6NCI5 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00862A6NCI5 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00862A6NCI5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00862A6NCI5 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00862A6NCI5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00862A6NCI5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00862A6NCI5 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00862A6NCI5 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00862A6NCI5 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00862A6NCI5 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00862A6NCI5 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00862A6NCI5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00862A6NCI5 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00862A6NCI5 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00862A6NCI5 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00862A6NCI5 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00862A6NCI5 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00862A6NCI5 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00862A6NCI5 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00862A6NCI5 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00862A6NCI5 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00862A6NCI5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00862A6NCI5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00862A6NCI5 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00862A6NCI5 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00862A6NCI5 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00862A6NCI5 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00862A6NCI5 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00862A6NCI5 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00862A6NCI5 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00862A6NCI5 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00862A6NCI5 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00862A6NCI5 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00862A6NCI5 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00862A6NCI5 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00862A6NCI5 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00862A6NCI5 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00862A6NCI5 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00862A6NCI5 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00862A6NCI5 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00862A6NCI5 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00862A6NCI5 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00862A6NCI5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00862A6NCI5 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00862A6NCI5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00862A6NCI5 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00862A6NCI5 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00862A6NCI5 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00862A6NCI5 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00862A6NCI5 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00862A6NCI5 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00862A6NCI5 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00862A6NCI5 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00862A6NCI5 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00862A6NCI5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00862A6NCI5 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00862A6NCI5 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00862A6NCI5 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00862A6NCI5 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00862A6NCI5 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms