Protein–RNA interactions for Protein: A6NCE7

MAP1LC3B2, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3 beta 2, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3B2A6NCE7 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms