Protein–RNA interactions for Protein: A0JP26

POTEB3, POTE ankyrin domain family member B3, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEB3A0JP26 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POTEB3A0JP26 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POTEB3A0JP26 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POTEB3A0JP26 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POTEB3A0JP26 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POTEB3A0JP26 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POTEB3A0JP26 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POTEB3A0JP26 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POTEB3A0JP26 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
POTEB3A0JP26 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POTEB3A0JP26 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
POTEB3A0JP26 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POTEB3A0JP26 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POTEB3A0JP26 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POTEB3A0JP26 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POTEB3A0JP26 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POTEB3A0JP26 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POTEB3A0JP26 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POTEB3A0JP26 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POTEB3A0JP26 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POTEB3A0JP26 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POTEB3A0JP26 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POTEB3A0JP26 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
POTEB3A0JP26 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POTEB3A0JP26 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POTEB3A0JP26 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POTEB3A0JP26 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POTEB3A0JP26 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POTEB3A0JP26 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POTEB3A0JP26 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POTEB3A0JP26 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POTEB3A0JP26 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POTEB3A0JP26 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POTEB3A0JP26 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POTEB3A0JP26 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POTEB3A0JP26 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POTEB3A0JP26 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POTEB3A0JP26 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POTEB3A0JP26 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POTEB3A0JP26 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POTEB3A0JP26 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POTEB3A0JP26 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POTEB3A0JP26 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POTEB3A0JP26 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POTEB3A0JP26 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
POTEB3A0JP26 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POTEB3A0JP26 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POTEB3A0JP26 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POTEB3A0JP26 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
POTEB3A0JP26 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POTEB3A0JP26 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POTEB3A0JP26 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POTEB3A0JP26 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POTEB3A0JP26 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POTEB3A0JP26 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POTEB3A0JP26 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POTEB3A0JP26 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POTEB3A0JP26 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POTEB3A0JP26 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POTEB3A0JP26 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POTEB3A0JP26 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POTEB3A0JP26 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POTEB3A0JP26 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POTEB3A0JP26 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POTEB3A0JP26 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POTEB3A0JP26 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
POTEB3A0JP26 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POTEB3A0JP26 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POTEB3A0JP26 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POTEB3A0JP26 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POTEB3A0JP26 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POTEB3A0JP26 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POTEB3A0JP26 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POTEB3A0JP26 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POTEB3A0JP26 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POTEB3A0JP26 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POTEB3A0JP26 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POTEB3A0JP26 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POTEB3A0JP26 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
POTEB3A0JP26 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POTEB3A0JP26 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POTEB3A0JP26 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POTEB3A0JP26 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POTEB3A0JP26 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POTEB3A0JP26 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POTEB3A0JP26 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POTEB3A0JP26 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POTEB3A0JP26 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POTEB3A0JP26 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POTEB3A0JP26 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POTEB3A0JP26 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
POTEB3A0JP26 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POTEB3A0JP26 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
POTEB3A0JP26 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POTEB3A0JP26 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POTEB3A0JP26 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POTEB3A0JP26 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POTEB3A0JP26 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POTEB3A0JP26 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POTEB3A0JP26 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms