Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQJ8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQJ8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A0U1RQJ8 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A0U1RQJ8 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A0U1RQJ8 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A0U1RQJ8 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A0U1RQJ8 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A0U1RQJ8 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A0U1RQJ8 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0U1RQJ8 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0U1RQJ8 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0U1RQJ8 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0U1RQJ8 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0U1RQJ8 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0U1RQJ8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0U1RQJ8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0U1RQJ8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0U1RQJ8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0U1RQJ8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0U1RQJ8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0U1RQJ8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0U1RQJ8 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0U1RQJ8 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0U1RQJ8 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0U1RQJ8 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0U1RQJ8 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0U1RQJ8 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0U1RQJ8 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0U1RQJ8 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A0U1RQJ8 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A0U1RQJ8 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A0U1RQJ8 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A0U1RQJ8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A0U1RQJ8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A0U1RQJ8 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A0U1RQJ8 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A0U1RQJ8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A0U1RQJ8 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0U1RQJ8 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0U1RQJ8 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0U1RQJ8 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0U1RQJ8 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0U1RQJ8 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0U1RQJ8 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0U1RQJ8 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0U1RQJ8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0U1RQJ8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0U1RQJ8 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0U1RQJ8 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0U1RQJ8 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0U1RQJ8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0U1RQJ8 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0U1RQJ8 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A0U1RQJ8 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A0U1RQJ8 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A0U1RQJ8 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A0U1RQJ8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A0U1RQJ8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A0U1RQJ8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A0U1RQJ8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A0U1RQJ8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A0U1RQJ8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A0U1RQJ8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A0U1RQJ8 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A0U1RQJ8 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A0U1RQJ8 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A0U1RQJ8 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A0U1RQJ8 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A0U1RQJ8 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A0U1RQJ8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A0U1RQJ8 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms