Protein–RNA interactions for Protein: A0A0K0K1G8

TRBV10-2, T-cell receptor beta variable 10-2 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TRBV10-2A0A0K0K1G8 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TRBV10-2A0A0K0K1G8 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
TRBV10-2A0A0K0K1G8 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRBV10-2A0A0K0K1G8 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRBV10-2A0A0K0K1G8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRBV10-2A0A0K0K1G8 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRBV10-2A0A0K0K1G8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRBV10-2A0A0K0K1G8 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRBV10-2A0A0K0K1G8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
TRBV10-2A0A0K0K1G8 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRBV10-2A0A0K0K1G8 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRBV10-2A0A0K0K1G8 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRBV10-2A0A0K0K1G8 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRBV10-2A0A0K0K1G8 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRBV10-2A0A0K0K1G8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRBV10-2A0A0K0K1G8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRBV10-2A0A0K0K1G8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRBV10-2A0A0K0K1G8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRBV10-2A0A0K0K1G8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
TRBV10-2A0A0K0K1G8 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRBV10-2A0A0K0K1G8 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRBV10-2A0A0K0K1G8 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRBV10-2A0A0K0K1G8 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRBV10-2A0A0K0K1G8 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRBV10-2A0A0K0K1G8 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
TRBV10-2A0A0K0K1G8 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TRBV10-2A0A0K0K1G8 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRBV10-2A0A0K0K1G8 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRBV10-2A0A0K0K1G8 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRBV10-2A0A0K0K1G8 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRBV10-2A0A0K0K1G8 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRBV10-2A0A0K0K1G8 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRBV10-2A0A0K0K1G8 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRBV10-2A0A0K0K1G8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRBV10-2A0A0K0K1G8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRBV10-2A0A0K0K1G8 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRBV10-2A0A0K0K1G8 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRBV10-2A0A0K0K1G8 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms