Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC12.61□□□□□ -0.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
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