Protein–RNA interactions for Protein: R4GMQ9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R4GMQ9 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
R4GMQ9 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
R4GMQ9 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
R4GMQ9 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
R4GMQ9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
R4GMQ9 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
R4GMQ9 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
R4GMQ9 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
R4GMQ9 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
R4GMQ9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
R4GMQ9 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
R4GMQ9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
R4GMQ9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
R4GMQ9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
R4GMQ9 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
R4GMQ9 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
R4GMQ9 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
R4GMQ9 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
R4GMQ9 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
R4GMQ9 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
R4GMQ9 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
R4GMQ9 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
R4GMQ9 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
R4GMQ9 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
R4GMQ9 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
R4GMQ9 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
R4GMQ9 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
R4GMQ9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
R4GMQ9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
R4GMQ9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
R4GMQ9 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
R4GMQ9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
R4GMQ9 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
R4GMQ9 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
R4GMQ9 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
R4GMQ9 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
R4GMQ9 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
R4GMQ9 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
R4GMQ9 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
R4GMQ9 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
R4GMQ9 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
R4GMQ9 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
R4GMQ9 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
R4GMQ9 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
R4GMQ9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
R4GMQ9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
R4GMQ9 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
R4GMQ9 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
R4GMQ9 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
R4GMQ9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
R4GMQ9 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
R4GMQ9 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
R4GMQ9 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
R4GMQ9 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
R4GMQ9 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
R4GMQ9 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
R4GMQ9 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
R4GMQ9 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
R4GMQ9 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
R4GMQ9 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
R4GMQ9 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
R4GMQ9 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
R4GMQ9 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
R4GMQ9 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
R4GMQ9 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
R4GMQ9 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
R4GMQ9 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
R4GMQ9 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
R4GMQ9 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
R4GMQ9 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
R4GMQ9 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
R4GMQ9 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
R4GMQ9 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
R4GMQ9 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
R4GMQ9 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
R4GMQ9 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
R4GMQ9 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
R4GMQ9 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
R4GMQ9 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
R4GMQ9 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
R4GMQ9 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
R4GMQ9 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
R4GMQ9 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
R4GMQ9 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
R4GMQ9 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
R4GMQ9 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
R4GMQ9 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
R4GMQ9 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
R4GMQ9 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
R4GMQ9 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
R4GMQ9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
R4GMQ9 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
R4GMQ9 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
R4GMQ9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
R4GMQ9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
R4GMQ9 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
R4GMQ9 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
R4GMQ9 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
R4GMQ9 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
R4GMQ9 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms