Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPN6Q9Y6Q1 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPN6Q9Y6Q1 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPN6Q9Y6Q1 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPN6Q9Y6Q1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPN6Q9Y6Q1 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPN6Q9Y6Q1 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPN6Q9Y6Q1 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPN6Q9Y6Q1 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPN6Q9Y6Q1 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPN6Q9Y6Q1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPN6Q9Y6Q1 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPN6Q9Y6Q1 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPN6Q9Y6Q1 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPN6Q9Y6Q1 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPN6Q9Y6Q1 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPN6Q9Y6Q1 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPN6Q9Y6Q1 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPN6Q9Y6Q1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPN6Q9Y6Q1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPN6Q9Y6Q1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPN6Q9Y6Q1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPN6Q9Y6Q1 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPN6Q9Y6Q1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPN6Q9Y6Q1 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPN6Q9Y6Q1 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPN6Q9Y6Q1 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPN6Q9Y6Q1 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CAPN6Q9Y6Q1 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CAPN6Q9Y6Q1 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CAPN6Q9Y6Q1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CAPN6Q9Y6Q1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CAPN6Q9Y6Q1 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAPN6Q9Y6Q1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAPN6Q9Y6Q1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAPN6Q9Y6Q1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAPN6Q9Y6Q1 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAPN6Q9Y6Q1 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAPN6Q9Y6Q1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAPN6Q9Y6Q1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAPN6Q9Y6Q1 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAPN6Q9Y6Q1 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAPN6Q9Y6Q1 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAPN6Q9Y6Q1 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAPN6Q9Y6Q1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CAPN6Q9Y6Q1 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAPN6Q9Y6Q1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAPN6Q9Y6Q1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAPN6Q9Y6Q1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAPN6Q9Y6Q1 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAPN6Q9Y6Q1 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPN6Q9Y6Q1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPN6Q9Y6Q1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPN6Q9Y6Q1 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPN6Q9Y6Q1 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPN6Q9Y6Q1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPN6Q9Y6Q1 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPN6Q9Y6Q1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPN6Q9Y6Q1 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPN6Q9Y6Q1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPN6Q9Y6Q1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPN6Q9Y6Q1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPN6Q9Y6Q1 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPN6Q9Y6Q1 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPN6Q9Y6Q1 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPN6Q9Y6Q1 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPN6Q9Y6Q1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPN6Q9Y6Q1 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPN6Q9Y6Q1 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPN6Q9Y6Q1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPN6Q9Y6Q1 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPN6Q9Y6Q1 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPN6Q9Y6Q1 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPN6Q9Y6Q1 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPN6Q9Y6Q1 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPN6Q9Y6Q1 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPN6Q9Y6Q1 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPN6Q9Y6Q1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPN6Q9Y6Q1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPN6Q9Y6Q1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPN6Q9Y6Q1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPN6Q9Y6Q1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPN6Q9Y6Q1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPN6Q9Y6Q1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPN6Q9Y6Q1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPN6Q9Y6Q1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPN6Q9Y6Q1 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPN6Q9Y6Q1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPN6Q9Y6Q1 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPN6Q9Y6Q1 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPN6Q9Y6Q1 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPN6Q9Y6Q1 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPN6Q9Y6Q1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPN6Q9Y6Q1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPN6Q9Y6Q1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPN6Q9Y6Q1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
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