Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y679

AUP1, Ancient ubiquitous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1Q9Y679 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms