Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P4

COL4A3BP, Collagen type IV alpha-3-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A3BPQ9Y5P4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
COL4A3BPQ9Y5P4 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
COL4A3BPQ9Y5P4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
COL4A3BPQ9Y5P4 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
COL4A3BPQ9Y5P4 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL4A3BPQ9Y5P4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL4A3BPQ9Y5P4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL4A3BPQ9Y5P4 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL4A3BPQ9Y5P4 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL4A3BPQ9Y5P4 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL4A3BPQ9Y5P4 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL4A3BPQ9Y5P4 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL4A3BPQ9Y5P4 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL4A3BPQ9Y5P4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL4A3BPQ9Y5P4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL4A3BPQ9Y5P4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL4A3BPQ9Y5P4 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COL4A3BPQ9Y5P4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COL4A3BPQ9Y5P4 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COL4A3BPQ9Y5P4 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COL4A3BPQ9Y5P4 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COL4A3BPQ9Y5P4 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COL4A3BPQ9Y5P4 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
COL4A3BPQ9Y5P4 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
COL4A3BPQ9Y5P4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COL4A3BPQ9Y5P4 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COL4A3BPQ9Y5P4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COL4A3BPQ9Y5P4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL4A3BPQ9Y5P4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL4A3BPQ9Y5P4 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL4A3BPQ9Y5P4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL4A3BPQ9Y5P4 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL4A3BPQ9Y5P4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL4A3BPQ9Y5P4 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL4A3BPQ9Y5P4 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL4A3BPQ9Y5P4 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
COL4A3BPQ9Y5P4 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL4A3BPQ9Y5P4 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL4A3BPQ9Y5P4 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL4A3BPQ9Y5P4 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL4A3BPQ9Y5P4 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL4A3BPQ9Y5P4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL4A3BPQ9Y5P4 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL4A3BPQ9Y5P4 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL4A3BPQ9Y5P4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COL4A3BPQ9Y5P4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COL4A3BPQ9Y5P4 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COL4A3BPQ9Y5P4 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
COL4A3BPQ9Y5P4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COL4A3BPQ9Y5P4 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COL4A3BPQ9Y5P4 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
COL4A3BPQ9Y5P4 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
COL4A3BPQ9Y5P4 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COL4A3BPQ9Y5P4 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COL4A3BPQ9Y5P4 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COL4A3BPQ9Y5P4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COL4A3BPQ9Y5P4 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COL4A3BPQ9Y5P4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COL4A3BPQ9Y5P4 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COL4A3BPQ9Y5P4 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
COL4A3BPQ9Y5P4 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL4A3BPQ9Y5P4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL4A3BPQ9Y5P4 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL4A3BPQ9Y5P4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL4A3BPQ9Y5P4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL4A3BPQ9Y5P4 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL4A3BPQ9Y5P4 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL4A3BPQ9Y5P4 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL4A3BPQ9Y5P4 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL4A3BPQ9Y5P4 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
COL4A3BPQ9Y5P4 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL4A3BPQ9Y5P4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL4A3BPQ9Y5P4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL4A3BPQ9Y5P4 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL4A3BPQ9Y5P4 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL4A3BPQ9Y5P4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL4A3BPQ9Y5P4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL4A3BPQ9Y5P4 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COL4A3BPQ9Y5P4 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COL4A3BPQ9Y5P4 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COL4A3BPQ9Y5P4 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COL4A3BPQ9Y5P4 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
COL4A3BPQ9Y5P4 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COL4A3BPQ9Y5P4 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COL4A3BPQ9Y5P4 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COL4A3BPQ9Y5P4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COL4A3BPQ9Y5P4 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COL4A3BPQ9Y5P4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COL4A3BPQ9Y5P4 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COL4A3BPQ9Y5P4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
COL4A3BPQ9Y5P4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COL4A3BPQ9Y5P4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COL4A3BPQ9Y5P4 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COL4A3BPQ9Y5P4 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COL4A3BPQ9Y5P4 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COL4A3BPQ9Y5P4 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COL4A3BPQ9Y5P4 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
COL4A3BPQ9Y5P4 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COL4A3BPQ9Y5P4 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COL4A3BPQ9Y5P4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms