Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5F1

PCDHB12, Protocadherin beta-12, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB12Q9Y5F1 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCDHB12Q9Y5F1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCDHB12Q9Y5F1 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCDHB12Q9Y5F1 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCDHB12Q9Y5F1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCDHB12Q9Y5F1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDHB12Q9Y5F1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDHB12Q9Y5F1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDHB12Q9Y5F1 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDHB12Q9Y5F1 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDHB12Q9Y5F1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDHB12Q9Y5F1 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDHB12Q9Y5F1 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDHB12Q9Y5F1 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDHB12Q9Y5F1 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDHB12Q9Y5F1 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDHB12Q9Y5F1 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDHB12Q9Y5F1 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDHB12Q9Y5F1 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDHB12Q9Y5F1 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDHB12Q9Y5F1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDHB12Q9Y5F1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDHB12Q9Y5F1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDHB12Q9Y5F1 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDHB12Q9Y5F1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDHB12Q9Y5F1 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDHB12Q9Y5F1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDHB12Q9Y5F1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDHB12Q9Y5F1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDHB12Q9Y5F1 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDHB12Q9Y5F1 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDHB12Q9Y5F1 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDHB12Q9Y5F1 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDHB12Q9Y5F1 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDHB12Q9Y5F1 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDHB12Q9Y5F1 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDHB12Q9Y5F1 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDHB12Q9Y5F1 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDHB12Q9Y5F1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDHB12Q9Y5F1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDHB12Q9Y5F1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDHB12Q9Y5F1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDHB12Q9Y5F1 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDHB12Q9Y5F1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDHB12Q9Y5F1 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDHB12Q9Y5F1 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDHB12Q9Y5F1 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDHB12Q9Y5F1 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDHB12Q9Y5F1 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDHB12Q9Y5F1 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDHB12Q9Y5F1 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDHB12Q9Y5F1 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDHB12Q9Y5F1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDHB12Q9Y5F1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDHB12Q9Y5F1 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDHB12Q9Y5F1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDHB12Q9Y5F1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDHB12Q9Y5F1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDHB12Q9Y5F1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDHB12Q9Y5F1 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDHB12Q9Y5F1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDHB12Q9Y5F1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDHB12Q9Y5F1 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDHB12Q9Y5F1 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDHB12Q9Y5F1 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDHB12Q9Y5F1 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDHB12Q9Y5F1 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDHB12Q9Y5F1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDHB12Q9Y5F1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDHB12Q9Y5F1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHB12Q9Y5F1 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHB12Q9Y5F1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHB12Q9Y5F1 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHB12Q9Y5F1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHB12Q9Y5F1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHB12Q9Y5F1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHB12Q9Y5F1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHB12Q9Y5F1 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHB12Q9Y5F1 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHB12Q9Y5F1 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHB12Q9Y5F1 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHB12Q9Y5F1 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHB12Q9Y5F1 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHB12Q9Y5F1 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHB12Q9Y5F1 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHB12Q9Y5F1 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHB12Q9Y5F1 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHB12Q9Y5F1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHB12Q9Y5F1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHB12Q9Y5F1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHB12Q9Y5F1 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHB12Q9Y5F1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHB12Q9Y5F1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHB12Q9Y5F1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHB12Q9Y5F1 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHB12Q9Y5F1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHB12Q9Y5F1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHB12Q9Y5F1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHB12Q9Y5F1 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHB12Q9Y5F1 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms