Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP15Q9Y4E8 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP15Q9Y4E8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP15Q9Y4E8 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP15Q9Y4E8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP15Q9Y4E8 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP15Q9Y4E8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP15Q9Y4E8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP15Q9Y4E8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP15Q9Y4E8 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP15Q9Y4E8 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP15Q9Y4E8 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP15Q9Y4E8 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
USP15Q9Y4E8 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP15Q9Y4E8 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP15Q9Y4E8 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP15Q9Y4E8 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP15Q9Y4E8 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP15Q9Y4E8 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP15Q9Y4E8 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP15Q9Y4E8 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP15Q9Y4E8 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP15Q9Y4E8 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP15Q9Y4E8 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP15Q9Y4E8 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
USP15Q9Y4E8 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP15Q9Y4E8 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP15Q9Y4E8 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP15Q9Y4E8 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP15Q9Y4E8 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP15Q9Y4E8 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
USP15Q9Y4E8 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP15Q9Y4E8 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP15Q9Y4E8 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP15Q9Y4E8 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP15Q9Y4E8 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP15Q9Y4E8 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP15Q9Y4E8 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP15Q9Y4E8 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP15Q9Y4E8 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP15Q9Y4E8 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP15Q9Y4E8 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP15Q9Y4E8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
USP15Q9Y4E8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP15Q9Y4E8 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP15Q9Y4E8 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP15Q9Y4E8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP15Q9Y4E8 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP15Q9Y4E8 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
USP15Q9Y4E8 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP15Q9Y4E8 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP15Q9Y4E8 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP15Q9Y4E8 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP15Q9Y4E8 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
USP15Q9Y4E8 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
USP15Q9Y4E8 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
USP15Q9Y4E8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP15Q9Y4E8 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
USP15Q9Y4E8 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP15Q9Y4E8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP15Q9Y4E8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP15Q9Y4E8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP15Q9Y4E8 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
USP15Q9Y4E8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
USP15Q9Y4E8 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
USP15Q9Y4E8 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP15Q9Y4E8 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP15Q9Y4E8 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP15Q9Y4E8 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP15Q9Y4E8 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP15Q9Y4E8 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
USP15Q9Y4E8 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP15Q9Y4E8 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP15Q9Y4E8 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP15Q9Y4E8 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP15Q9Y4E8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP15Q9Y4E8 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP15Q9Y4E8 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP15Q9Y4E8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP15Q9Y4E8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP15Q9Y4E8 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP15Q9Y4E8 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP15Q9Y4E8 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP15Q9Y4E8 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP15Q9Y4E8 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP15Q9Y4E8 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP15Q9Y4E8 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP15Q9Y4E8 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP15Q9Y4E8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP15Q9Y4E8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP15Q9Y4E8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP15Q9Y4E8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP15Q9Y4E8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP15Q9Y4E8 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP15Q9Y4E8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP15Q9Y4E8 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP15Q9Y4E8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP15Q9Y4E8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP15Q9Y4E8 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP15Q9Y4E8 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms