Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G9

SBNO2, Protein strawberry notch homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO2Q9Y2G9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SBNO2Q9Y2G9 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SBNO2Q9Y2G9 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SBNO2Q9Y2G9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SBNO2Q9Y2G9 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SBNO2Q9Y2G9 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SBNO2Q9Y2G9 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SBNO2Q9Y2G9 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SBNO2Q9Y2G9 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SBNO2Q9Y2G9 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SBNO2Q9Y2G9 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SBNO2Q9Y2G9 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SBNO2Q9Y2G9 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SBNO2Q9Y2G9 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SBNO2Q9Y2G9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SBNO2Q9Y2G9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SBNO2Q9Y2G9 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SBNO2Q9Y2G9 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SBNO2Q9Y2G9 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SBNO2Q9Y2G9 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SBNO2Q9Y2G9 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SBNO2Q9Y2G9 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SBNO2Q9Y2G9 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SBNO2Q9Y2G9 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SBNO2Q9Y2G9 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SBNO2Q9Y2G9 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SBNO2Q9Y2G9 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SBNO2Q9Y2G9 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SBNO2Q9Y2G9 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SBNO2Q9Y2G9 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SBNO2Q9Y2G9 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SBNO2Q9Y2G9 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SBNO2Q9Y2G9 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SBNO2Q9Y2G9 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SBNO2Q9Y2G9 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
SBNO2Q9Y2G9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SBNO2Q9Y2G9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SBNO2Q9Y2G9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SBNO2Q9Y2G9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SBNO2Q9Y2G9 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SBNO2Q9Y2G9 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SBNO2Q9Y2G9 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SBNO2Q9Y2G9 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SBNO2Q9Y2G9 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SBNO2Q9Y2G9 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SBNO2Q9Y2G9 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SBNO2Q9Y2G9 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SBNO2Q9Y2G9 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SBNO2Q9Y2G9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SBNO2Q9Y2G9 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SBNO2Q9Y2G9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SBNO2Q9Y2G9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SBNO2Q9Y2G9 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SBNO2Q9Y2G9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SBNO2Q9Y2G9 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SBNO2Q9Y2G9 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SBNO2Q9Y2G9 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SBNO2Q9Y2G9 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SBNO2Q9Y2G9 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SBNO2Q9Y2G9 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SBNO2Q9Y2G9 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SBNO2Q9Y2G9 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SBNO2Q9Y2G9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SBNO2Q9Y2G9 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SBNO2Q9Y2G9 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SBNO2Q9Y2G9 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
SBNO2Q9Y2G9 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SBNO2Q9Y2G9 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SBNO2Q9Y2G9 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SBNO2Q9Y2G9 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SBNO2Q9Y2G9 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SBNO2Q9Y2G9 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SBNO2Q9Y2G9 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SBNO2Q9Y2G9 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SBNO2Q9Y2G9 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SBNO2Q9Y2G9 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SBNO2Q9Y2G9 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SBNO2Q9Y2G9 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SBNO2Q9Y2G9 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SBNO2Q9Y2G9 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SBNO2Q9Y2G9 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SBNO2Q9Y2G9 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SBNO2Q9Y2G9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SBNO2Q9Y2G9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SBNO2Q9Y2G9 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SBNO2Q9Y2G9 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SBNO2Q9Y2G9 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SBNO2Q9Y2G9 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SBNO2Q9Y2G9 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SBNO2Q9Y2G9 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SBNO2Q9Y2G9 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
SBNO2Q9Y2G9 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SBNO2Q9Y2G9 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SBNO2Q9Y2G9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SBNO2Q9Y2G9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SBNO2Q9Y2G9 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SBNO2Q9Y2G9 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SBNO2Q9Y2G9 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SBNO2Q9Y2G9 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SBNO2Q9Y2G9 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms