Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms