Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y239

NOD1, Nucleotide-binding oligomerization domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOD1Q9Y239 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NOD1Q9Y239 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NOD1Q9Y239 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NOD1Q9Y239 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NOD1Q9Y239 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NOD1Q9Y239 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NOD1Q9Y239 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NOD1Q9Y239 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NOD1Q9Y239 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NOD1Q9Y239 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NOD1Q9Y239 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NOD1Q9Y239 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NOD1Q9Y239 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NOD1Q9Y239 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NOD1Q9Y239 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NOD1Q9Y239 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NOD1Q9Y239 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NOD1Q9Y239 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NOD1Q9Y239 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NOD1Q9Y239 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NOD1Q9Y239 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NOD1Q9Y239 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NOD1Q9Y239 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NOD1Q9Y239 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NOD1Q9Y239 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NOD1Q9Y239 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NOD1Q9Y239 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NOD1Q9Y239 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NOD1Q9Y239 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NOD1Q9Y239 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NOD1Q9Y239 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NOD1Q9Y239 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NOD1Q9Y239 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NOD1Q9Y239 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NOD1Q9Y239 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NOD1Q9Y239 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NOD1Q9Y239 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NOD1Q9Y239 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NOD1Q9Y239 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NOD1Q9Y239 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NOD1Q9Y239 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NOD1Q9Y239 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NOD1Q9Y239 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NOD1Q9Y239 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NOD1Q9Y239 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NOD1Q9Y239 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NOD1Q9Y239 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NOD1Q9Y239 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NOD1Q9Y239 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NOD1Q9Y239 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NOD1Q9Y239 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NOD1Q9Y239 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NOD1Q9Y239 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NOD1Q9Y239 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
NOD1Q9Y239 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NOD1Q9Y239 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NOD1Q9Y239 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NOD1Q9Y239 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NOD1Q9Y239 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NOD1Q9Y239 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NOD1Q9Y239 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NOD1Q9Y239 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NOD1Q9Y239 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NOD1Q9Y239 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NOD1Q9Y239 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NOD1Q9Y239 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NOD1Q9Y239 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NOD1Q9Y239 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NOD1Q9Y239 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NOD1Q9Y239 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NOD1Q9Y239 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NOD1Q9Y239 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NOD1Q9Y239 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NOD1Q9Y239 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NOD1Q9Y239 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NOD1Q9Y239 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NOD1Q9Y239 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NOD1Q9Y239 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NOD1Q9Y239 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NOD1Q9Y239 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NOD1Q9Y239 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NOD1Q9Y239 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NOD1Q9Y239 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NOD1Q9Y239 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NOD1Q9Y239 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NOD1Q9Y239 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NOD1Q9Y239 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NOD1Q9Y239 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NOD1Q9Y239 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NOD1Q9Y239 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NOD1Q9Y239 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NOD1Q9Y239 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NOD1Q9Y239 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NOD1Q9Y239 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NOD1Q9Y239 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NOD1Q9Y239 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NOD1Q9Y239 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NOD1Q9Y239 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NOD1Q9Y239 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NOD1Q9Y239 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms