Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HPS5Q9UPZ3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HPS5Q9UPZ3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HPS5Q9UPZ3 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HPS5Q9UPZ3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
HPS5Q9UPZ3 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
HPS5Q9UPZ3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HPS5Q9UPZ3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
HPS5Q9UPZ3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
HPS5Q9UPZ3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
HPS5Q9UPZ3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HPS5Q9UPZ3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HPS5Q9UPZ3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HPS5Q9UPZ3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HPS5Q9UPZ3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HPS5Q9UPZ3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HPS5Q9UPZ3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HPS5Q9UPZ3 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HPS5Q9UPZ3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HPS5Q9UPZ3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HPS5Q9UPZ3 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
HPS5Q9UPZ3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HPS5Q9UPZ3 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HPS5Q9UPZ3 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HPS5Q9UPZ3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
HPS5Q9UPZ3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HPS5Q9UPZ3 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HPS5Q9UPZ3 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HPS5Q9UPZ3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HPS5Q9UPZ3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HPS5Q9UPZ3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HPS5Q9UPZ3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
HPS5Q9UPZ3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HPS5Q9UPZ3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HPS5Q9UPZ3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HPS5Q9UPZ3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HPS5Q9UPZ3 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
HPS5Q9UPZ3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
HPS5Q9UPZ3 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HPS5Q9UPZ3 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HPS5Q9UPZ3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HPS5Q9UPZ3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
HPS5Q9UPZ3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HPS5Q9UPZ3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HPS5Q9UPZ3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HPS5Q9UPZ3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HPS5Q9UPZ3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HPS5Q9UPZ3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HPS5Q9UPZ3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HPS5Q9UPZ3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HPS5Q9UPZ3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HPS5Q9UPZ3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
HPS5Q9UPZ3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HPS5Q9UPZ3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HPS5Q9UPZ3 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HPS5Q9UPZ3 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HPS5Q9UPZ3 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HPS5Q9UPZ3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HPS5Q9UPZ3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HPS5Q9UPZ3 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
HPS5Q9UPZ3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HPS5Q9UPZ3 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HPS5Q9UPZ3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HPS5Q9UPZ3 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HPS5Q9UPZ3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HPS5Q9UPZ3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HPS5Q9UPZ3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HPS5Q9UPZ3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
HPS5Q9UPZ3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HPS5Q9UPZ3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HPS5Q9UPZ3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HPS5Q9UPZ3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HPS5Q9UPZ3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HPS5Q9UPZ3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HPS5Q9UPZ3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HPS5Q9UPZ3 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HPS5Q9UPZ3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HPS5Q9UPZ3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HPS5Q9UPZ3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HPS5Q9UPZ3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HPS5Q9UPZ3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HPS5Q9UPZ3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HPS5Q9UPZ3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HPS5Q9UPZ3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HPS5Q9UPZ3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HPS5Q9UPZ3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HPS5Q9UPZ3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HPS5Q9UPZ3 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HPS5Q9UPZ3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HPS5Q9UPZ3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HPS5Q9UPZ3 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HPS5Q9UPZ3 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HPS5Q9UPZ3 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HPS5Q9UPZ3 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
HPS5Q9UPZ3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HPS5Q9UPZ3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HPS5Q9UPZ3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HPS5Q9UPZ3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HPS5Q9UPZ3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HPS5Q9UPZ3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms