Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM35Q9UPQ4 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM35Q9UPQ4 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM35Q9UPQ4 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM35Q9UPQ4 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM35Q9UPQ4 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM35Q9UPQ4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM35Q9UPQ4 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM35Q9UPQ4 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM35Q9UPQ4 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM35Q9UPQ4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM35Q9UPQ4 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM35Q9UPQ4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM35Q9UPQ4 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM35Q9UPQ4 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM35Q9UPQ4 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM35Q9UPQ4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM35Q9UPQ4 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM35Q9UPQ4 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM35Q9UPQ4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM35Q9UPQ4 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM35Q9UPQ4 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM35Q9UPQ4 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM35Q9UPQ4 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM35Q9UPQ4 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM35Q9UPQ4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM35Q9UPQ4 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM35Q9UPQ4 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM35Q9UPQ4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM35Q9UPQ4 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM35Q9UPQ4 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM35Q9UPQ4 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM35Q9UPQ4 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM35Q9UPQ4 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM35Q9UPQ4 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM35Q9UPQ4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM35Q9UPQ4 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM35Q9UPQ4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM35Q9UPQ4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM35Q9UPQ4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM35Q9UPQ4 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM35Q9UPQ4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM35Q9UPQ4 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM35Q9UPQ4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM35Q9UPQ4 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM35Q9UPQ4 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM35Q9UPQ4 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM35Q9UPQ4 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM35Q9UPQ4 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM35Q9UPQ4 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM35Q9UPQ4 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM35Q9UPQ4 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM35Q9UPQ4 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM35Q9UPQ4 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM35Q9UPQ4 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM35Q9UPQ4 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM35Q9UPQ4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM35Q9UPQ4 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM35Q9UPQ4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM35Q9UPQ4 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM35Q9UPQ4 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM35Q9UPQ4 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM35Q9UPQ4 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM35Q9UPQ4 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM35Q9UPQ4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM35Q9UPQ4 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM35Q9UPQ4 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM35Q9UPQ4 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM35Q9UPQ4 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM35Q9UPQ4 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM35Q9UPQ4 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM35Q9UPQ4 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM35Q9UPQ4 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM35Q9UPQ4 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM35Q9UPQ4 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM35Q9UPQ4 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM35Q9UPQ4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM35Q9UPQ4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM35Q9UPQ4 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM35Q9UPQ4 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM35Q9UPQ4 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM35Q9UPQ4 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM35Q9UPQ4 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM35Q9UPQ4 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM35Q9UPQ4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM35Q9UPQ4 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM35Q9UPQ4 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM35Q9UPQ4 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM35Q9UPQ4 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM35Q9UPQ4 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM35Q9UPQ4 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM35Q9UPQ4 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM35Q9UPQ4 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM35Q9UPQ4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM35Q9UPQ4 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM35Q9UPQ4 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM35Q9UPQ4 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM35Q9UPQ4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM35Q9UPQ4 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM35Q9UPQ4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms