Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PHF8Q9UPP1 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PHF8Q9UPP1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PHF8Q9UPP1 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PHF8Q9UPP1 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PHF8Q9UPP1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PHF8Q9UPP1 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PHF8Q9UPP1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PHF8Q9UPP1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PHF8Q9UPP1 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PHF8Q9UPP1 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PHF8Q9UPP1 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PHF8Q9UPP1 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PHF8Q9UPP1 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PHF8Q9UPP1 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PHF8Q9UPP1 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PHF8Q9UPP1 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PHF8Q9UPP1 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PHF8Q9UPP1 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PHF8Q9UPP1 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PHF8Q9UPP1 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PHF8Q9UPP1 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PHF8Q9UPP1 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PHF8Q9UPP1 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PHF8Q9UPP1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PHF8Q9UPP1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PHF8Q9UPP1 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PHF8Q9UPP1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PHF8Q9UPP1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PHF8Q9UPP1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PHF8Q9UPP1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PHF8Q9UPP1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PHF8Q9UPP1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PHF8Q9UPP1 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PHF8Q9UPP1 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
PHF8Q9UPP1 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PHF8Q9UPP1 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PHF8Q9UPP1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PHF8Q9UPP1 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PHF8Q9UPP1 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
PHF8Q9UPP1 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PHF8Q9UPP1 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PHF8Q9UPP1 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PHF8Q9UPP1 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PHF8Q9UPP1 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PHF8Q9UPP1 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PHF8Q9UPP1 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PHF8Q9UPP1 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PHF8Q9UPP1 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PHF8Q9UPP1 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
PHF8Q9UPP1 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PHF8Q9UPP1 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PHF8Q9UPP1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PHF8Q9UPP1 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PHF8Q9UPP1 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PHF8Q9UPP1 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
PHF8Q9UPP1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PHF8Q9UPP1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PHF8Q9UPP1 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PHF8Q9UPP1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
PHF8Q9UPP1 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
PHF8Q9UPP1 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PHF8Q9UPP1 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PHF8Q9UPP1 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PHF8Q9UPP1 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PHF8Q9UPP1 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PHF8Q9UPP1 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PHF8Q9UPP1 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PHF8Q9UPP1 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PHF8Q9UPP1 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PHF8Q9UPP1 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PHF8Q9UPP1 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PHF8Q9UPP1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PHF8Q9UPP1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PHF8Q9UPP1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PHF8Q9UPP1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PHF8Q9UPP1 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PHF8Q9UPP1 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PHF8Q9UPP1 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PHF8Q9UPP1 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PHF8Q9UPP1 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PHF8Q9UPP1 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PHF8Q9UPP1 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PHF8Q9UPP1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PHF8Q9UPP1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PHF8Q9UPP1 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PHF8Q9UPP1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PHF8Q9UPP1 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PHF8Q9UPP1 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PHF8Q9UPP1 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PHF8Q9UPP1 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PHF8Q9UPP1 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PHF8Q9UPP1 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PHF8Q9UPP1 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PHF8Q9UPP1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PHF8Q9UPP1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PHF8Q9UPP1 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PHF8Q9UPP1 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PHF8Q9UPP1 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PHF8Q9UPP1 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms