Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTF2Q9UNY4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTF2Q9UNY4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTF2Q9UNY4 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTF2Q9UNY4 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTF2Q9UNY4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTF2Q9UNY4 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TTF2Q9UNY4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTF2Q9UNY4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTF2Q9UNY4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTF2Q9UNY4 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTF2Q9UNY4 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTF2Q9UNY4 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTF2Q9UNY4 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTF2Q9UNY4 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTF2Q9UNY4 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTF2Q9UNY4 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTF2Q9UNY4 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTF2Q9UNY4 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTF2Q9UNY4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTF2Q9UNY4 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTF2Q9UNY4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTF2Q9UNY4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTF2Q9UNY4 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTF2Q9UNY4 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTF2Q9UNY4 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTF2Q9UNY4 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTF2Q9UNY4 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTF2Q9UNY4 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTF2Q9UNY4 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTF2Q9UNY4 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTF2Q9UNY4 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTF2Q9UNY4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTF2Q9UNY4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TTF2Q9UNY4 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTF2Q9UNY4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTF2Q9UNY4 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTF2Q9UNY4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTF2Q9UNY4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTF2Q9UNY4 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTF2Q9UNY4 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTF2Q9UNY4 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTF2Q9UNY4 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTF2Q9UNY4 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTF2Q9UNY4 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TTF2Q9UNY4 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTF2Q9UNY4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTF2Q9UNY4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTF2Q9UNY4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTF2Q9UNY4 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTF2Q9UNY4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTF2Q9UNY4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTF2Q9UNY4 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTF2Q9UNY4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTF2Q9UNY4 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TTF2Q9UNY4 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTF2Q9UNY4 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTF2Q9UNY4 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TTF2Q9UNY4 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTF2Q9UNY4 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTF2Q9UNY4 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTF2Q9UNY4 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTF2Q9UNY4 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTF2Q9UNY4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTF2Q9UNY4 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTF2Q9UNY4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTF2Q9UNY4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTF2Q9UNY4 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTF2Q9UNY4 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TTF2Q9UNY4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TTF2Q9UNY4 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TTF2Q9UNY4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TTF2Q9UNY4 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TTF2Q9UNY4 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TTF2Q9UNY4 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TTF2Q9UNY4 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TTF2Q9UNY4 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TTF2Q9UNY4 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TTF2Q9UNY4 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TTF2Q9UNY4 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TTF2Q9UNY4 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TTF2Q9UNY4 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TTF2Q9UNY4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TTF2Q9UNY4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TTF2Q9UNY4 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTF2Q9UNY4 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTF2Q9UNY4 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTF2Q9UNY4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTF2Q9UNY4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTF2Q9UNY4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTF2Q9UNY4 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTF2Q9UNY4 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTF2Q9UNY4 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTF2Q9UNY4 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTF2Q9UNY4 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TTF2Q9UNY4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTF2Q9UNY4 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTF2Q9UNY4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TTF2Q9UNY4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTF2Q9UNY4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms