Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULY5

CLEC4E, C-type lectin domain family 4 member E, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4EQ9ULY5 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLEC4EQ9ULY5 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLEC4EQ9ULY5 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLEC4EQ9ULY5 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLEC4EQ9ULY5 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLEC4EQ9ULY5 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLEC4EQ9ULY5 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLEC4EQ9ULY5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLEC4EQ9ULY5 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLEC4EQ9ULY5 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CLEC4EQ9ULY5 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLEC4EQ9ULY5 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLEC4EQ9ULY5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLEC4EQ9ULY5 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLEC4EQ9ULY5 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CLEC4EQ9ULY5 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLEC4EQ9ULY5 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLEC4EQ9ULY5 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLEC4EQ9ULY5 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLEC4EQ9ULY5 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLEC4EQ9ULY5 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLEC4EQ9ULY5 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLEC4EQ9ULY5 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLEC4EQ9ULY5 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLEC4EQ9ULY5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLEC4EQ9ULY5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLEC4EQ9ULY5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLEC4EQ9ULY5 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLEC4EQ9ULY5 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLEC4EQ9ULY5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLEC4EQ9ULY5 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLEC4EQ9ULY5 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLEC4EQ9ULY5 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLEC4EQ9ULY5 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLEC4EQ9ULY5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLEC4EQ9ULY5 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLEC4EQ9ULY5 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CLEC4EQ9ULY5 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLEC4EQ9ULY5 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLEC4EQ9ULY5 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLEC4EQ9ULY5 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLEC4EQ9ULY5 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLEC4EQ9ULY5 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CLEC4EQ9ULY5 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLEC4EQ9ULY5 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CLEC4EQ9ULY5 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLEC4EQ9ULY5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLEC4EQ9ULY5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CLEC4EQ9ULY5 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CLEC4EQ9ULY5 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CLEC4EQ9ULY5 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CLEC4EQ9ULY5 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CLEC4EQ9ULY5 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms