Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV3

CIZ1, Cip1-interacting zinc finger protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIZ1Q9ULV3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CIZ1Q9ULV3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CIZ1Q9ULV3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CIZ1Q9ULV3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CIZ1Q9ULV3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CIZ1Q9ULV3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CIZ1Q9ULV3 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CIZ1Q9ULV3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CIZ1Q9ULV3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CIZ1Q9ULV3 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CIZ1Q9ULV3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CIZ1Q9ULV3 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CIZ1Q9ULV3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CIZ1Q9ULV3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CIZ1Q9ULV3 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CIZ1Q9ULV3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CIZ1Q9ULV3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CIZ1Q9ULV3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CIZ1Q9ULV3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CIZ1Q9ULV3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CIZ1Q9ULV3 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CIZ1Q9ULV3 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CIZ1Q9ULV3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CIZ1Q9ULV3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CIZ1Q9ULV3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CIZ1Q9ULV3 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CIZ1Q9ULV3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CIZ1Q9ULV3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CIZ1Q9ULV3 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CIZ1Q9ULV3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CIZ1Q9ULV3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CIZ1Q9ULV3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CIZ1Q9ULV3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CIZ1Q9ULV3 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CIZ1Q9ULV3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CIZ1Q9ULV3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CIZ1Q9ULV3 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CIZ1Q9ULV3 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CIZ1Q9ULV3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CIZ1Q9ULV3 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CIZ1Q9ULV3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CIZ1Q9ULV3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CIZ1Q9ULV3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CIZ1Q9ULV3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CIZ1Q9ULV3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CIZ1Q9ULV3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CIZ1Q9ULV3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CIZ1Q9ULV3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CIZ1Q9ULV3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CIZ1Q9ULV3 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CIZ1Q9ULV3 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CIZ1Q9ULV3 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CIZ1Q9ULV3 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CIZ1Q9ULV3 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CIZ1Q9ULV3 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CIZ1Q9ULV3 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CIZ1Q9ULV3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CIZ1Q9ULV3 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CIZ1Q9ULV3 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CIZ1Q9ULV3 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CIZ1Q9ULV3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CIZ1Q9ULV3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CIZ1Q9ULV3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CIZ1Q9ULV3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CIZ1Q9ULV3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CIZ1Q9ULV3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CIZ1Q9ULV3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CIZ1Q9ULV3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CIZ1Q9ULV3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CIZ1Q9ULV3 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CIZ1Q9ULV3 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CIZ1Q9ULV3 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CIZ1Q9ULV3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CIZ1Q9ULV3 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CIZ1Q9ULV3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CIZ1Q9ULV3 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CIZ1Q9ULV3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CIZ1Q9ULV3 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CIZ1Q9ULV3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CIZ1Q9ULV3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CIZ1Q9ULV3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CIZ1Q9ULV3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CIZ1Q9ULV3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CIZ1Q9ULV3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CIZ1Q9ULV3 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CIZ1Q9ULV3 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CIZ1Q9ULV3 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CIZ1Q9ULV3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CIZ1Q9ULV3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CIZ1Q9ULV3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CIZ1Q9ULV3 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CIZ1Q9ULV3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CIZ1Q9ULV3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CIZ1Q9ULV3 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CIZ1Q9ULV3 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CIZ1Q9ULV3 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CIZ1Q9ULV3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CIZ1Q9ULV3 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CIZ1Q9ULV3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CIZ1Q9ULV3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms