Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULH4

LRFN2, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN2Q9ULH4 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LRFN2Q9ULH4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRFN2Q9ULH4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRFN2Q9ULH4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRFN2Q9ULH4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRFN2Q9ULH4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRFN2Q9ULH4 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRFN2Q9ULH4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRFN2Q9ULH4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRFN2Q9ULH4 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRFN2Q9ULH4 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRFN2Q9ULH4 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRFN2Q9ULH4 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LRFN2Q9ULH4 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRFN2Q9ULH4 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRFN2Q9ULH4 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRFN2Q9ULH4 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LRFN2Q9ULH4 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRFN2Q9ULH4 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRFN2Q9ULH4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRFN2Q9ULH4 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRFN2Q9ULH4 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRFN2Q9ULH4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRFN2Q9ULH4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRFN2Q9ULH4 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRFN2Q9ULH4 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRFN2Q9ULH4 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRFN2Q9ULH4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRFN2Q9ULH4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRFN2Q9ULH4 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRFN2Q9ULH4 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRFN2Q9ULH4 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRFN2Q9ULH4 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRFN2Q9ULH4 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRFN2Q9ULH4 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRFN2Q9ULH4 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRFN2Q9ULH4 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRFN2Q9ULH4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRFN2Q9ULH4 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRFN2Q9ULH4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRFN2Q9ULH4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRFN2Q9ULH4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRFN2Q9ULH4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRFN2Q9ULH4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRFN2Q9ULH4 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRFN2Q9ULH4 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRFN2Q9ULH4 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRFN2Q9ULH4 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRFN2Q9ULH4 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRFN2Q9ULH4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRFN2Q9ULH4 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRFN2Q9ULH4 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRFN2Q9ULH4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRFN2Q9ULH4 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRFN2Q9ULH4 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRFN2Q9ULH4 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRFN2Q9ULH4 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRFN2Q9ULH4 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRFN2Q9ULH4 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRFN2Q9ULH4 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRFN2Q9ULH4 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRFN2Q9ULH4 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRFN2Q9ULH4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRFN2Q9ULH4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRFN2Q9ULH4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRFN2Q9ULH4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRFN2Q9ULH4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRFN2Q9ULH4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRFN2Q9ULH4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRFN2Q9ULH4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRFN2Q9ULH4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRFN2Q9ULH4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRFN2Q9ULH4 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRFN2Q9ULH4 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRFN2Q9ULH4 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRFN2Q9ULH4 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRFN2Q9ULH4 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LRFN2Q9ULH4 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRFN2Q9ULH4 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRFN2Q9ULH4 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRFN2Q9ULH4 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRFN2Q9ULH4 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRFN2Q9ULH4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRFN2Q9ULH4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRFN2Q9ULH4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRFN2Q9ULH4 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRFN2Q9ULH4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRFN2Q9ULH4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRFN2Q9ULH4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRFN2Q9ULH4 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRFN2Q9ULH4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRFN2Q9ULH4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRFN2Q9ULH4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRFN2Q9ULH4 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRFN2Q9ULH4 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRFN2Q9ULH4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRFN2Q9ULH4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRFN2Q9ULH4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRFN2Q9ULH4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRFN2Q9ULH4 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms