Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL16

CFAP45, Cilia- and flagella-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP45Q9UL16 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CFAP45Q9UL16 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CFAP45Q9UL16 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CFAP45Q9UL16 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CFAP45Q9UL16 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CFAP45Q9UL16 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CFAP45Q9UL16 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CFAP45Q9UL16 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CFAP45Q9UL16 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CFAP45Q9UL16 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CFAP45Q9UL16 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CFAP45Q9UL16 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CFAP45Q9UL16 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CFAP45Q9UL16 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CFAP45Q9UL16 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CFAP45Q9UL16 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CFAP45Q9UL16 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CFAP45Q9UL16 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CFAP45Q9UL16 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CFAP45Q9UL16 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CFAP45Q9UL16 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CFAP45Q9UL16 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CFAP45Q9UL16 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CFAP45Q9UL16 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CFAP45Q9UL16 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CFAP45Q9UL16 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CFAP45Q9UL16 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CFAP45Q9UL16 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CFAP45Q9UL16 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CFAP45Q9UL16 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CFAP45Q9UL16 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CFAP45Q9UL16 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CFAP45Q9UL16 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CFAP45Q9UL16 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CFAP45Q9UL16 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CFAP45Q9UL16 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CFAP45Q9UL16 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CFAP45Q9UL16 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CFAP45Q9UL16 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CFAP45Q9UL16 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CFAP45Q9UL16 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CFAP45Q9UL16 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CFAP45Q9UL16 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CFAP45Q9UL16 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CFAP45Q9UL16 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CFAP45Q9UL16 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CFAP45Q9UL16 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CFAP45Q9UL16 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CFAP45Q9UL16 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CFAP45Q9UL16 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CFAP45Q9UL16 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CFAP45Q9UL16 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CFAP45Q9UL16 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CFAP45Q9UL16 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CFAP45Q9UL16 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CFAP45Q9UL16 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CFAP45Q9UL16 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CFAP45Q9UL16 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CFAP45Q9UL16 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CFAP45Q9UL16 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CFAP45Q9UL16 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CFAP45Q9UL16 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CFAP45Q9UL16 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CFAP45Q9UL16 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CFAP45Q9UL16 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CFAP45Q9UL16 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CFAP45Q9UL16 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CFAP45Q9UL16 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CFAP45Q9UL16 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CFAP45Q9UL16 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CFAP45Q9UL16 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CFAP45Q9UL16 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CFAP45Q9UL16 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CFAP45Q9UL16 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CFAP45Q9UL16 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CFAP45Q9UL16 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CFAP45Q9UL16 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CFAP45Q9UL16 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CFAP45Q9UL16 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CFAP45Q9UL16 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CFAP45Q9UL16 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CFAP45Q9UL16 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CFAP45Q9UL16 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CFAP45Q9UL16 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CFAP45Q9UL16 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CFAP45Q9UL16 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CFAP45Q9UL16 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CFAP45Q9UL16 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CFAP45Q9UL16 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CFAP45Q9UL16 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CFAP45Q9UL16 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CFAP45Q9UL16 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CFAP45Q9UL16 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CFAP45Q9UL16 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CFAP45Q9UL16 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CFAP45Q9UL16 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CFAP45Q9UL16 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CFAP45Q9UL16 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CFAP45Q9UL16 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CFAP45Q9UL16 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms