Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK58

CCNL1, Cyclin-L1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL1Q9UK58 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCNL1Q9UK58 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCNL1Q9UK58 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCNL1Q9UK58 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCNL1Q9UK58 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCNL1Q9UK58 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCNL1Q9UK58 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCNL1Q9UK58 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCNL1Q9UK58 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCNL1Q9UK58 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCNL1Q9UK58 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCNL1Q9UK58 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCNL1Q9UK58 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CCNL1Q9UK58 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCNL1Q9UK58 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCNL1Q9UK58 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCNL1Q9UK58 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCNL1Q9UK58 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CCNL1Q9UK58 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCNL1Q9UK58 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCNL1Q9UK58 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCNL1Q9UK58 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCNL1Q9UK58 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCNL1Q9UK58 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCNL1Q9UK58 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCNL1Q9UK58 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCNL1Q9UK58 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCNL1Q9UK58 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCNL1Q9UK58 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCNL1Q9UK58 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCNL1Q9UK58 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCNL1Q9UK58 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCNL1Q9UK58 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CCNL1Q9UK58 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCNL1Q9UK58 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCNL1Q9UK58 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCNL1Q9UK58 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCNL1Q9UK58 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCNL1Q9UK58 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCNL1Q9UK58 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCNL1Q9UK58 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCNL1Q9UK58 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCNL1Q9UK58 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCNL1Q9UK58 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCNL1Q9UK58 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCNL1Q9UK58 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCNL1Q9UK58 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCNL1Q9UK58 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCNL1Q9UK58 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCNL1Q9UK58 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCNL1Q9UK58 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CCNL1Q9UK58 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCNL1Q9UK58 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCNL1Q9UK58 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCNL1Q9UK58 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCNL1Q9UK58 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCNL1Q9UK58 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCNL1Q9UK58 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCNL1Q9UK58 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCNL1Q9UK58 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCNL1Q9UK58 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCNL1Q9UK58 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCNL1Q9UK58 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CCNL1Q9UK58 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCNL1Q9UK58 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCNL1Q9UK58 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCNL1Q9UK58 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCNL1Q9UK58 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCNL1Q9UK58 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCNL1Q9UK58 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCNL1Q9UK58 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCNL1Q9UK58 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCNL1Q9UK58 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCNL1Q9UK58 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCNL1Q9UK58 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCNL1Q9UK58 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCNL1Q9UK58 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCNL1Q9UK58 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCNL1Q9UK58 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCNL1Q9UK58 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCNL1Q9UK58 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCNL1Q9UK58 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCNL1Q9UK58 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCNL1Q9UK58 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCNL1Q9UK58 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CCNL1Q9UK58 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCNL1Q9UK58 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCNL1Q9UK58 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCNL1Q9UK58 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCNL1Q9UK58 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCNL1Q9UK58 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCNL1Q9UK58 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCNL1Q9UK58 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCNL1Q9UK58 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCNL1Q9UK58 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCNL1Q9UK58 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCNL1Q9UK58 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCNL1Q9UK58 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCNL1Q9UK58 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCNL1Q9UK58 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms