Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GGA1Q9UJY5 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GGA1Q9UJY5 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GGA1Q9UJY5 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GGA1Q9UJY5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GGA1Q9UJY5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GGA1Q9UJY5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GGA1Q9UJY5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GGA1Q9UJY5 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GGA1Q9UJY5 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GGA1Q9UJY5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GGA1Q9UJY5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GGA1Q9UJY5 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GGA1Q9UJY5 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GGA1Q9UJY5 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GGA1Q9UJY5 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GGA1Q9UJY5 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GGA1Q9UJY5 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GGA1Q9UJY5 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GGA1Q9UJY5 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GGA1Q9UJY5 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GGA1Q9UJY5 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GGA1Q9UJY5 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GGA1Q9UJY5 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GGA1Q9UJY5 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GGA1Q9UJY5 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GGA1Q9UJY5 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GGA1Q9UJY5 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GGA1Q9UJY5 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GGA1Q9UJY5 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GGA1Q9UJY5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GGA1Q9UJY5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GGA1Q9UJY5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GGA1Q9UJY5 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GGA1Q9UJY5 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GGA1Q9UJY5 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GGA1Q9UJY5 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GGA1Q9UJY5 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GGA1Q9UJY5 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
GGA1Q9UJY5 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GGA1Q9UJY5 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GGA1Q9UJY5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GGA1Q9UJY5 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GGA1Q9UJY5 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GGA1Q9UJY5 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GGA1Q9UJY5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GGA1Q9UJY5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GGA1Q9UJY5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GGA1Q9UJY5 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GGA1Q9UJY5 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GGA1Q9UJY5 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GGA1Q9UJY5 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GGA1Q9UJY5 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GGA1Q9UJY5 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GGA1Q9UJY5 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GGA1Q9UJY5 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GGA1Q9UJY5 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GGA1Q9UJY5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GGA1Q9UJY5 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GGA1Q9UJY5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GGA1Q9UJY5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GGA1Q9UJY5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GGA1Q9UJY5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GGA1Q9UJY5 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GGA1Q9UJY5 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GGA1Q9UJY5 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GGA1Q9UJY5 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GGA1Q9UJY5 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GGA1Q9UJY5 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GGA1Q9UJY5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GGA1Q9UJY5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GGA1Q9UJY5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GGA1Q9UJY5 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GGA1Q9UJY5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GGA1Q9UJY5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GGA1Q9UJY5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GGA1Q9UJY5 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GGA1Q9UJY5 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GGA1Q9UJY5 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GGA1Q9UJY5 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GGA1Q9UJY5 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GGA1Q9UJY5 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GGA1Q9UJY5 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GGA1Q9UJY5 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GGA1Q9UJY5 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GGA1Q9UJY5 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GGA1Q9UJY5 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GGA1Q9UJY5 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GGA1Q9UJY5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GGA1Q9UJY5 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GGA1Q9UJY5 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GGA1Q9UJY5 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
GGA1Q9UJY5 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GGA1Q9UJY5 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GGA1Q9UJY5 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GGA1Q9UJY5 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GGA1Q9UJY5 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GGA1Q9UJY5 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GGA1Q9UJY5 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GGA1Q9UJY5 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms