Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHX1

PUF60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60Q9UHX1 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.27
PUF60Q9UHX1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PUF60Q9UHX1 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PUF60Q9UHX1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PUF60Q9UHX1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PUF60Q9UHX1 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PUF60Q9UHX1 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PUF60Q9UHX1 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PUF60Q9UHX1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PUF60Q9UHX1 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PUF60Q9UHX1 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PUF60Q9UHX1 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PUF60Q9UHX1 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PUF60Q9UHX1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PUF60Q9UHX1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PUF60Q9UHX1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PUF60Q9UHX1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PUF60Q9UHX1 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PUF60Q9UHX1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PUF60Q9UHX1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PUF60Q9UHX1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PUF60Q9UHX1 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PUF60Q9UHX1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PUF60Q9UHX1 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PUF60Q9UHX1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PUF60Q9UHX1 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PUF60Q9UHX1 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PUF60Q9UHX1 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PUF60Q9UHX1 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PUF60Q9UHX1 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
PUF60Q9UHX1 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PUF60Q9UHX1 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PUF60Q9UHX1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms